Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK7

VSIG1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG1Q86XK7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VSIG1Q86XK7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VSIG1Q86XK7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VSIG1Q86XK7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VSIG1Q86XK7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VSIG1Q86XK7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VSIG1Q86XK7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VSIG1Q86XK7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VSIG1Q86XK7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VSIG1Q86XK7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VSIG1Q86XK7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VSIG1Q86XK7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VSIG1Q86XK7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VSIG1Q86XK7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VSIG1Q86XK7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VSIG1Q86XK7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VSIG1Q86XK7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VSIG1Q86XK7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VSIG1Q86XK7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VSIG1Q86XK7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VSIG1Q86XK7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VSIG1Q86XK7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
VSIG1Q86XK7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
VSIG1Q86XK7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VSIG1Q86XK7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VSIG1Q86XK7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VSIG1Q86XK7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VSIG1Q86XK7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VSIG1Q86XK7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VSIG1Q86XK7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VSIG1Q86XK7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VSIG1Q86XK7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VSIG1Q86XK7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VSIG1Q86XK7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VSIG1Q86XK7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VSIG1Q86XK7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VSIG1Q86XK7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VSIG1Q86XK7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VSIG1Q86XK7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VSIG1Q86XK7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
VSIG1Q86XK7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VSIG1Q86XK7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VSIG1Q86XK7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VSIG1Q86XK7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VSIG1Q86XK7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
VSIG1Q86XK7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VSIG1Q86XK7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VSIG1Q86XK7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VSIG1Q86XK7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VSIG1Q86XK7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VSIG1Q86XK7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VSIG1Q86XK7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VSIG1Q86XK7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VSIG1Q86XK7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VSIG1Q86XK7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VSIG1Q86XK7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VSIG1Q86XK7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VSIG1Q86XK7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
VSIG1Q86XK7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms