Protein–RNA interactions for Protein: Q86X45

LRRC6, Protein tilB homolog, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC6Q86X45 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC6Q86X45 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC6Q86X45 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC6Q86X45 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC6Q86X45 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC6Q86X45 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC6Q86X45 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC6Q86X45 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC6Q86X45 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC6Q86X45 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC6Q86X45 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC6Q86X45 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC6Q86X45 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC6Q86X45 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC6Q86X45 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC6Q86X45 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC6Q86X45 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC6Q86X45 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC6Q86X45 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC6Q86X45 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC6Q86X45 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC6Q86X45 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC6Q86X45 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC6Q86X45 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC6Q86X45 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC6Q86X45 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC6Q86X45 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC6Q86X45 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC6Q86X45 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC6Q86X45 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC6Q86X45 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC6Q86X45 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC6Q86X45 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC6Q86X45 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC6Q86X45 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC6Q86X45 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC6Q86X45 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRC6Q86X45 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC6Q86X45 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC6Q86X45 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC6Q86X45 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC6Q86X45 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC6Q86X45 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC6Q86X45 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC6Q86X45 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC6Q86X45 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC6Q86X45 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC6Q86X45 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC6Q86X45 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC6Q86X45 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC6Q86X45 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC6Q86X45 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC6Q86X45 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC6Q86X45 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC6Q86X45 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC6Q86X45 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms