Protein–RNA interactions for Protein: Q86VH5

LRRTM3, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3Q86VH5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRTM3Q86VH5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRTM3Q86VH5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRTM3Q86VH5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRTM3Q86VH5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRTM3Q86VH5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRTM3Q86VH5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRTM3Q86VH5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRTM3Q86VH5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRTM3Q86VH5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRTM3Q86VH5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRTM3Q86VH5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRTM3Q86VH5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRTM3Q86VH5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRTM3Q86VH5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRTM3Q86VH5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRTM3Q86VH5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRTM3Q86VH5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRTM3Q86VH5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRTM3Q86VH5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRTM3Q86VH5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRTM3Q86VH5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRTM3Q86VH5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRTM3Q86VH5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRTM3Q86VH5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRTM3Q86VH5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRTM3Q86VH5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRTM3Q86VH5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRTM3Q86VH5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRTM3Q86VH5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRTM3Q86VH5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRTM3Q86VH5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRTM3Q86VH5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRTM3Q86VH5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRTM3Q86VH5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRTM3Q86VH5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRTM3Q86VH5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRTM3Q86VH5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRTM3Q86VH5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRTM3Q86VH5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRTM3Q86VH5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRTM3Q86VH5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRTM3Q86VH5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRTM3Q86VH5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRTM3Q86VH5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRTM3Q86VH5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRTM3Q86VH5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRTM3Q86VH5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRTM3Q86VH5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRTM3Q86VH5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRTM3Q86VH5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRTM3Q86VH5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRTM3Q86VH5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRTM3Q86VH5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRTM3Q86VH5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRTM3Q86VH5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRTM3Q86VH5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRTM3Q86VH5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRTM3Q86VH5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRTM3Q86VH5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRTM3Q86VH5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRTM3Q86VH5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRTM3Q86VH5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRTM3Q86VH5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRTM3Q86VH5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRTM3Q86VH5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRTM3Q86VH5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRTM3Q86VH5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRTM3Q86VH5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRTM3Q86VH5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRTM3Q86VH5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRTM3Q86VH5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRTM3Q86VH5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRTM3Q86VH5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRTM3Q86VH5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRTM3Q86VH5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRTM3Q86VH5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRTM3Q86VH5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRTM3Q86VH5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRTM3Q86VH5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRTM3Q86VH5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRTM3Q86VH5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRTM3Q86VH5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRTM3Q86VH5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRRTM3Q86VH5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRTM3Q86VH5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRTM3Q86VH5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRTM3Q86VH5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRTM3Q86VH5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRTM3Q86VH5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRTM3Q86VH5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRTM3Q86VH5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRTM3Q86VH5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRTM3Q86VH5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRTM3Q86VH5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRTM3Q86VH5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRTM3Q86VH5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRTM3Q86VH5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRTM3Q86VH5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRTM3Q86VH5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms