Protein–RNA interactions for Protein: Q86UP9

LHFPL3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHFPL3Q86UP9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHFPL3Q86UP9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHFPL3Q86UP9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHFPL3Q86UP9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHFPL3Q86UP9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHFPL3Q86UP9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHFPL3Q86UP9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHFPL3Q86UP9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHFPL3Q86UP9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHFPL3Q86UP9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHFPL3Q86UP9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHFPL3Q86UP9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHFPL3Q86UP9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHFPL3Q86UP9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHFPL3Q86UP9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHFPL3Q86UP9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHFPL3Q86UP9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHFPL3Q86UP9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHFPL3Q86UP9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LHFPL3Q86UP9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LHFPL3Q86UP9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHFPL3Q86UP9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHFPL3Q86UP9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHFPL3Q86UP9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHFPL3Q86UP9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHFPL3Q86UP9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHFPL3Q86UP9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHFPL3Q86UP9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHFPL3Q86UP9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHFPL3Q86UP9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHFPL3Q86UP9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHFPL3Q86UP9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHFPL3Q86UP9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHFPL3Q86UP9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHFPL3Q86UP9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHFPL3Q86UP9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHFPL3Q86UP9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHFPL3Q86UP9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHFPL3Q86UP9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHFPL3Q86UP9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LHFPL3Q86UP9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHFPL3Q86UP9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHFPL3Q86UP9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHFPL3Q86UP9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHFPL3Q86UP9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHFPL3Q86UP9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHFPL3Q86UP9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHFPL3Q86UP9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHFPL3Q86UP9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHFPL3Q86UP9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHFPL3Q86UP9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHFPL3Q86UP9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHFPL3Q86UP9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHFPL3Q86UP9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LHFPL3Q86UP9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHFPL3Q86UP9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHFPL3Q86UP9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHFPL3Q86UP9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHFPL3Q86UP9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHFPL3Q86UP9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHFPL3Q86UP9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHFPL3Q86UP9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHFPL3Q86UP9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHFPL3Q86UP9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHFPL3Q86UP9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHFPL3Q86UP9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHFPL3Q86UP9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHFPL3Q86UP9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHFPL3Q86UP9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHFPL3Q86UP9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHFPL3Q86UP9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LHFPL3Q86UP9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHFPL3Q86UP9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHFPL3Q86UP9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHFPL3Q86UP9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHFPL3Q86UP9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHFPL3Q86UP9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHFPL3Q86UP9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHFPL3Q86UP9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHFPL3Q86UP9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHFPL3Q86UP9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHFPL3Q86UP9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHFPL3Q86UP9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHFPL3Q86UP9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHFPL3Q86UP9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHFPL3Q86UP9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHFPL3Q86UP9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHFPL3Q86UP9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHFPL3Q86UP9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHFPL3Q86UP9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHFPL3Q86UP9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHFPL3Q86UP9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHFPL3Q86UP9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHFPL3Q86UP9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHFPL3Q86UP9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHFPL3Q86UP9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHFPL3Q86UP9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHFPL3Q86UP9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHFPL3Q86UP9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LHFPL3Q86UP9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms