Protein–RNA interactions for Protein: Q86SG4

HMGN2P46, Putative Dresden prostate carcinoma protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN2P46Q86SG4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGN2P46Q86SG4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGN2P46Q86SG4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGN2P46Q86SG4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGN2P46Q86SG4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGN2P46Q86SG4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGN2P46Q86SG4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HMGN2P46Q86SG4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGN2P46Q86SG4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.2 ms