Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE9

PCGF5, Polycomb group RING finger protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF5Q86SE9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCGF5Q86SE9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCGF5Q86SE9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCGF5Q86SE9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCGF5Q86SE9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCGF5Q86SE9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCGF5Q86SE9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCGF5Q86SE9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCGF5Q86SE9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCGF5Q86SE9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCGF5Q86SE9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCGF5Q86SE9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCGF5Q86SE9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCGF5Q86SE9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCGF5Q86SE9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCGF5Q86SE9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCGF5Q86SE9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCGF5Q86SE9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCGF5Q86SE9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCGF5Q86SE9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCGF5Q86SE9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCGF5Q86SE9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCGF5Q86SE9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCGF5Q86SE9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCGF5Q86SE9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCGF5Q86SE9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PCGF5Q86SE9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF5Q86SE9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF5Q86SE9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF5Q86SE9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF5Q86SE9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF5Q86SE9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF5Q86SE9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PCGF5Q86SE9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCGF5Q86SE9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCGF5Q86SE9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCGF5Q86SE9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCGF5Q86SE9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCGF5Q86SE9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCGF5Q86SE9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCGF5Q86SE9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCGF5Q86SE9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PCGF5Q86SE9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCGF5Q86SE9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCGF5Q86SE9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCGF5Q86SE9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCGF5Q86SE9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCGF5Q86SE9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCGF5Q86SE9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCGF5Q86SE9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCGF5Q86SE9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCGF5Q86SE9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCGF5Q86SE9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCGF5Q86SE9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PCGF5Q86SE9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCGF5Q86SE9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCGF5Q86SE9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCGF5Q86SE9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCGF5Q86SE9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCGF5Q86SE9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCGF5Q86SE9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCGF5Q86SE9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCGF5Q86SE9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCGF5Q86SE9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PCGF5Q86SE9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PCGF5Q86SE9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PCGF5Q86SE9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PCGF5Q86SE9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PCGF5Q86SE9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PCGF5Q86SE9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PCGF5Q86SE9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PCGF5Q86SE9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PCGF5Q86SE9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PCGF5Q86SE9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCGF5Q86SE9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCGF5Q86SE9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCGF5Q86SE9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCGF5Q86SE9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCGF5Q86SE9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCGF5Q86SE9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PCGF5Q86SE9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCGF5Q86SE9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCGF5Q86SE9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCGF5Q86SE9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCGF5Q86SE9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCGF5Q86SE9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCGF5Q86SE9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCGF5Q86SE9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCGF5Q86SE9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCGF5Q86SE9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCGF5Q86SE9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCGF5Q86SE9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCGF5Q86SE9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCGF5Q86SE9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PCGF5Q86SE9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCGF5Q86SE9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCGF5Q86SE9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCGF5Q86SE9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCGF5Q86SE9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCGF5Q86SE9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms