Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5M5

TMC3, Transmembrane channel-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3Q7Z5M5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMC3Q7Z5M5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMC3Q7Z5M5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMC3Q7Z5M5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMC3Q7Z5M5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMC3Q7Z5M5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TMC3Q7Z5M5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMC3Q7Z5M5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMC3Q7Z5M5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMC3Q7Z5M5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMC3Q7Z5M5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMC3Q7Z5M5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMC3Q7Z5M5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMC3Q7Z5M5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMC3Q7Z5M5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMC3Q7Z5M5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMC3Q7Z5M5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TMC3Q7Z5M5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMC3Q7Z5M5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMC3Q7Z5M5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC3Q7Z5M5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC3Q7Z5M5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC3Q7Z5M5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC3Q7Z5M5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC3Q7Z5M5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC3Q7Z5M5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC3Q7Z5M5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC3Q7Z5M5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC3Q7Z5M5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC3Q7Z5M5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC3Q7Z5M5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC3Q7Z5M5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC3Q7Z5M5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC3Q7Z5M5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC3Q7Z5M5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC3Q7Z5M5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC3Q7Z5M5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC3Q7Z5M5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC3Q7Z5M5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC3Q7Z5M5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC3Q7Z5M5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC3Q7Z5M5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC3Q7Z5M5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC3Q7Z5M5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC3Q7Z5M5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC3Q7Z5M5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC3Q7Z5M5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC3Q7Z5M5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMC3Q7Z5M5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMC3Q7Z5M5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMC3Q7Z5M5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMC3Q7Z5M5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMC3Q7Z5M5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMC3Q7Z5M5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMC3Q7Z5M5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMC3Q7Z5M5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMC3Q7Z5M5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMC3Q7Z5M5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMC3Q7Z5M5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMC3Q7Z5M5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMC3Q7Z5M5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMC3Q7Z5M5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMC3Q7Z5M5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMC3Q7Z5M5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMC3Q7Z5M5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMC3Q7Z5M5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMC3Q7Z5M5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMC3Q7Z5M5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMC3Q7Z5M5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TMC3Q7Z5M5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMC3Q7Z5M5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMC3Q7Z5M5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMC3Q7Z5M5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMC3Q7Z5M5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMC3Q7Z5M5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMC3Q7Z5M5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMC3Q7Z5M5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMC3Q7Z5M5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMC3Q7Z5M5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMC3Q7Z5M5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMC3Q7Z5M5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMC3Q7Z5M5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMC3Q7Z5M5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMC3Q7Z5M5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMC3Q7Z5M5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TMC3Q7Z5M5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TMC3Q7Z5M5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMC3Q7Z5M5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMC3Q7Z5M5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMC3Q7Z5M5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMC3Q7Z5M5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMC3Q7Z5M5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMC3Q7Z5M5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMC3Q7Z5M5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMC3Q7Z5M5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMC3Q7Z5M5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMC3Q7Z5M5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMC3Q7Z5M5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMC3Q7Z5M5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMC3Q7Z5M5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms