Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B0

SMIM15, Small integral membrane protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM15Q7Z3B0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM15Q7Z3B0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms