Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
OTOP3Q7RTS5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
OTOP3Q7RTS5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
OTOP3Q7RTS5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
OTOP3Q7RTS5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
OTOP3Q7RTS5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
OTOP3Q7RTS5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
OTOP3Q7RTS5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
OTOP3Q7RTS5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
OTOP3Q7RTS5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
OTOP3Q7RTS5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
OTOP3Q7RTS5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
OTOP3Q7RTS5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
OTOP3Q7RTS5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
OTOP3Q7RTS5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
OTOP3Q7RTS5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
OTOP3Q7RTS5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
OTOP3Q7RTS5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
OTOP3Q7RTS5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
OTOP3Q7RTS5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
OTOP3Q7RTS5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
OTOP3Q7RTS5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
OTOP3Q7RTS5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
OTOP3Q7RTS5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
OTOP3Q7RTS5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
OTOP3Q7RTS5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
OTOP3Q7RTS5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
OTOP3Q7RTS5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
OTOP3Q7RTS5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
OTOP3Q7RTS5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
OTOP3Q7RTS5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
OTOP3Q7RTS5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
OTOP3Q7RTS5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
OTOP3Q7RTS5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
OTOP3Q7RTS5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
OTOP3Q7RTS5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26■■□□□ 1.75
OTOP3Q7RTS5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
OTOP3Q7RTS5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26■■□□□ 1.75
OTOP3Q7RTS5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
OTOP3Q7RTS5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
OTOP3Q7RTS5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26■■□□□ 1.75
OTOP3Q7RTS5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTOP3Q7RTS5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTOP3Q7RTS5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTOP3Q7RTS5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTOP3Q7RTS5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTOP3Q7RTS5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTOP3Q7RTS5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
OTOP3Q7RTS5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTOP3Q7RTS5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
OTOP3Q7RTS5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTOP3Q7RTS5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTOP3Q7RTS5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTOP3Q7RTS5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTOP3Q7RTS5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTOP3Q7RTS5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTOP3Q7RTS5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTOP3Q7RTS5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTOP3Q7RTS5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTOP3Q7RTS5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTOP3Q7RTS5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
OTOP3Q7RTS5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
OTOP3Q7RTS5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
OTOP3Q7RTS5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
OTOP3Q7RTS5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
OTOP3Q7RTS5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
OTOP3Q7RTS5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
OTOP3Q7RTS5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
OTOP3Q7RTS5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
OTOP3Q7RTS5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
OTOP3Q7RTS5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
OTOP3Q7RTS5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
OTOP3Q7RTS5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTOP3Q7RTS5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTOP3Q7RTS5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTOP3Q7RTS5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTOP3Q7RTS5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTOP3Q7RTS5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTOP3Q7RTS5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
OTOP3Q7RTS5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
OTOP3Q7RTS5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
OTOP3Q7RTS5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
OTOP3Q7RTS5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
OTOP3Q7RTS5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
OTOP3Q7RTS5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
OTOP3Q7RTS5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
OTOP3Q7RTS5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
OTOP3Q7RTS5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTOP3Q7RTS5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTOP3Q7RTS5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTOP3Q7RTS5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTOP3Q7RTS5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTOP3Q7RTS5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTOP3Q7RTS5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
OTOP3Q7RTS5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
OTOP3Q7RTS5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
OTOP3Q7RTS5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
OTOP3Q7RTS5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
OTOP3Q7RTS5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
OTOP3Q7RTS5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms