Protein–RNA interactions for Protein: Q7L8S5

OTUD6A, OTU domain-containing protein 6A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD6AQ7L8S5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
OTUD6AQ7L8S5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
OTUD6AQ7L8S5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
OTUD6AQ7L8S5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
OTUD6AQ7L8S5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
OTUD6AQ7L8S5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
OTUD6AQ7L8S5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
OTUD6AQ7L8S5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
OTUD6AQ7L8S5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
OTUD6AQ7L8S5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
OTUD6AQ7L8S5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
OTUD6AQ7L8S5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
OTUD6AQ7L8S5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
OTUD6AQ7L8S5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
OTUD6AQ7L8S5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
OTUD6AQ7L8S5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
OTUD6AQ7L8S5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
OTUD6AQ7L8S5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
OTUD6AQ7L8S5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
OTUD6AQ7L8S5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
OTUD6AQ7L8S5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
OTUD6AQ7L8S5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
OTUD6AQ7L8S5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
OTUD6AQ7L8S5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
OTUD6AQ7L8S5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
OTUD6AQ7L8S5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
OTUD6AQ7L8S5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
OTUD6AQ7L8S5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
OTUD6AQ7L8S5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
OTUD6AQ7L8S5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
OTUD6AQ7L8S5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
OTUD6AQ7L8S5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
OTUD6AQ7L8S5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
OTUD6AQ7L8S5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
OTUD6AQ7L8S5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
OTUD6AQ7L8S5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
OTUD6AQ7L8S5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
OTUD6AQ7L8S5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
OTUD6AQ7L8S5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
OTUD6AQ7L8S5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
OTUD6AQ7L8S5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
OTUD6AQ7L8S5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
OTUD6AQ7L8S5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
OTUD6AQ7L8S5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
OTUD6AQ7L8S5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
OTUD6AQ7L8S5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
OTUD6AQ7L8S5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
OTUD6AQ7L8S5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
OTUD6AQ7L8S5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
OTUD6AQ7L8S5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
OTUD6AQ7L8S5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
OTUD6AQ7L8S5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
OTUD6AQ7L8S5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
OTUD6AQ7L8S5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
OTUD6AQ7L8S5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
OTUD6AQ7L8S5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
OTUD6AQ7L8S5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
OTUD6AQ7L8S5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
OTUD6AQ7L8S5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
OTUD6AQ7L8S5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
OTUD6AQ7L8S5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
OTUD6AQ7L8S5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
OTUD6AQ7L8S5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
OTUD6AQ7L8S5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
OTUD6AQ7L8S5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
OTUD6AQ7L8S5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
OTUD6AQ7L8S5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
OTUD6AQ7L8S5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
OTUD6AQ7L8S5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
OTUD6AQ7L8S5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
OTUD6AQ7L8S5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
OTUD6AQ7L8S5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
OTUD6AQ7L8S5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
OTUD6AQ7L8S5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
OTUD6AQ7L8S5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
OTUD6AQ7L8S5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
OTUD6AQ7L8S5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
OTUD6AQ7L8S5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
OTUD6AQ7L8S5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
OTUD6AQ7L8S5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
OTUD6AQ7L8S5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
OTUD6AQ7L8S5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
OTUD6AQ7L8S5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
OTUD6AQ7L8S5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
OTUD6AQ7L8S5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
OTUD6AQ7L8S5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
OTUD6AQ7L8S5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
OTUD6AQ7L8S5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
OTUD6AQ7L8S5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
OTUD6AQ7L8S5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
OTUD6AQ7L8S5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
OTUD6AQ7L8S5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
OTUD6AQ7L8S5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
OTUD6AQ7L8S5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
OTUD6AQ7L8S5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
OTUD6AQ7L8S5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
OTUD6AQ7L8S5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
OTUD6AQ7L8S5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
OTUD6AQ7L8S5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
OTUD6AQ7L8S5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms