Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDPD3Q7L5L3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDPD3Q7L5L3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDPD3Q7L5L3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDPD3Q7L5L3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDPD3Q7L5L3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDPD3Q7L5L3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDPD3Q7L5L3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDPD3Q7L5L3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDPD3Q7L5L3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDPD3Q7L5L3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDPD3Q7L5L3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDPD3Q7L5L3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDPD3Q7L5L3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GDPD3Q7L5L3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDPD3Q7L5L3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDPD3Q7L5L3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDPD3Q7L5L3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDPD3Q7L5L3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDPD3Q7L5L3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDPD3Q7L5L3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDPD3Q7L5L3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GDPD3Q7L5L3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDPD3Q7L5L3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDPD3Q7L5L3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDPD3Q7L5L3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDPD3Q7L5L3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDPD3Q7L5L3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDPD3Q7L5L3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GDPD3Q7L5L3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDPD3Q7L5L3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDPD3Q7L5L3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDPD3Q7L5L3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDPD3Q7L5L3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDPD3Q7L5L3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDPD3Q7L5L3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDPD3Q7L5L3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDPD3Q7L5L3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDPD3Q7L5L3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDPD3Q7L5L3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GDPD3Q7L5L3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDPD3Q7L5L3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDPD3Q7L5L3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDPD3Q7L5L3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GDPD3Q7L5L3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDPD3Q7L5L3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDPD3Q7L5L3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDPD3Q7L5L3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GDPD3Q7L5L3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDPD3Q7L5L3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDPD3Q7L5L3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDPD3Q7L5L3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDPD3Q7L5L3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDPD3Q7L5L3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDPD3Q7L5L3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDPD3Q7L5L3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDPD3Q7L5L3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDPD3Q7L5L3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDPD3Q7L5L3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDPD3Q7L5L3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDPD3Q7L5L3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDPD3Q7L5L3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDPD3Q7L5L3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDPD3Q7L5L3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDPD3Q7L5L3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GDPD3Q7L5L3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDPD3Q7L5L3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDPD3Q7L5L3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDPD3Q7L5L3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDPD3Q7L5L3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDPD3Q7L5L3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDPD3Q7L5L3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDPD3Q7L5L3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDPD3Q7L5L3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDPD3Q7L5L3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDPD3Q7L5L3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDPD3Q7L5L3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDPD3Q7L5L3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDPD3Q7L5L3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDPD3Q7L5L3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDPD3Q7L5L3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDPD3Q7L5L3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDPD3Q7L5L3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GDPD3Q7L5L3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDPD3Q7L5L3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDPD3Q7L5L3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDPD3Q7L5L3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDPD3Q7L5L3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GDPD3Q7L5L3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDPD3Q7L5L3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDPD3Q7L5L3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDPD3Q7L5L3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDPD3Q7L5L3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDPD3Q7L5L3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDPD3Q7L5L3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDPD3Q7L5L3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDPD3Q7L5L3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GDPD3Q7L5L3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDPD3Q7L5L3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDPD3Q7L5L3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms