Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR62

RTL4, Retrotransposon Gag-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL4Q6ZR62 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTL4Q6ZR62 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTL4Q6ZR62 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTL4Q6ZR62 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTL4Q6ZR62 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RTL4Q6ZR62 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTL4Q6ZR62 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTL4Q6ZR62 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTL4Q6ZR62 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RTL4Q6ZR62 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTL4Q6ZR62 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTL4Q6ZR62 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTL4Q6ZR62 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTL4Q6ZR62 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTL4Q6ZR62 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTL4Q6ZR62 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTL4Q6ZR62 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTL4Q6ZR62 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL4Q6ZR62 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL4Q6ZR62 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL4Q6ZR62 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTL4Q6ZR62 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RTL4Q6ZR62 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTL4Q6ZR62 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTL4Q6ZR62 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RTL4Q6ZR62 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL4Q6ZR62 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL4Q6ZR62 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL4Q6ZR62 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL4Q6ZR62 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL4Q6ZR62 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL4Q6ZR62 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL4Q6ZR62 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL4Q6ZR62 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTL4Q6ZR62 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTL4Q6ZR62 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTL4Q6ZR62 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL4Q6ZR62 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL4Q6ZR62 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL4Q6ZR62 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL4Q6ZR62 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL4Q6ZR62 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL4Q6ZR62 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL4Q6ZR62 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL4Q6ZR62 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL4Q6ZR62 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL4Q6ZR62 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL4Q6ZR62 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL4Q6ZR62 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL4Q6ZR62 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL4Q6ZR62 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL4Q6ZR62 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL4Q6ZR62 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL4Q6ZR62 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL4Q6ZR62 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL4Q6ZR62 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL4Q6ZR62 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL4Q6ZR62 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTL4Q6ZR62 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTL4Q6ZR62 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTL4Q6ZR62 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTL4Q6ZR62 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTL4Q6ZR62 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTL4Q6ZR62 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTL4Q6ZR62 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTL4Q6ZR62 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTL4Q6ZR62 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTL4Q6ZR62 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTL4Q6ZR62 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RTL4Q6ZR62 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTL4Q6ZR62 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTL4Q6ZR62 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTL4Q6ZR62 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTL4Q6ZR62 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTL4Q6ZR62 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTL4Q6ZR62 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTL4Q6ZR62 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTL4Q6ZR62 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTL4Q6ZR62 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTL4Q6ZR62 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RTL4Q6ZR62 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTL4Q6ZR62 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTL4Q6ZR62 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTL4Q6ZR62 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTL4Q6ZR62 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTL4Q6ZR62 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTL4Q6ZR62 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTL4Q6ZR62 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTL4Q6ZR62 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTL4Q6ZR62 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTL4Q6ZR62 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RTL4Q6ZR62 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTL4Q6ZR62 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTL4Q6ZR62 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTL4Q6ZR62 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RTL4Q6ZR62 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTL4Q6ZR62 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTL4Q6ZR62 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTL4Q6ZR62 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTL4Q6ZR62 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms