Protein–RNA interactions for Protein: Q6WBX8

RAD9B, Cell cycle checkpoint control protein RAD9B, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9BQ6WBX8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAD9BQ6WBX8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RAD9BQ6WBX8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAD9BQ6WBX8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAD9BQ6WBX8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAD9BQ6WBX8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAD9BQ6WBX8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAD9BQ6WBX8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAD9BQ6WBX8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAD9BQ6WBX8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAD9BQ6WBX8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAD9BQ6WBX8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAD9BQ6WBX8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAD9BQ6WBX8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAD9BQ6WBX8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAD9BQ6WBX8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAD9BQ6WBX8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD9BQ6WBX8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD9BQ6WBX8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD9BQ6WBX8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD9BQ6WBX8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD9BQ6WBX8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD9BQ6WBX8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAD9BQ6WBX8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAD9BQ6WBX8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAD9BQ6WBX8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAD9BQ6WBX8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAD9BQ6WBX8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAD9BQ6WBX8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAD9BQ6WBX8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAD9BQ6WBX8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAD9BQ6WBX8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAD9BQ6WBX8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAD9BQ6WBX8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RAD9BQ6WBX8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RAD9BQ6WBX8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RAD9BQ6WBX8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAD9BQ6WBX8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAD9BQ6WBX8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAD9BQ6WBX8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAD9BQ6WBX8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RAD9BQ6WBX8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAD9BQ6WBX8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAD9BQ6WBX8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAD9BQ6WBX8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAD9BQ6WBX8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAD9BQ6WBX8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAD9BQ6WBX8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAD9BQ6WBX8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAD9BQ6WBX8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAD9BQ6WBX8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAD9BQ6WBX8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAD9BQ6WBX8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAD9BQ6WBX8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAD9BQ6WBX8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAD9BQ6WBX8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAD9BQ6WBX8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAD9BQ6WBX8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RAD9BQ6WBX8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAD9BQ6WBX8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAD9BQ6WBX8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAD9BQ6WBX8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAD9BQ6WBX8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAD9BQ6WBX8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAD9BQ6WBX8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAD9BQ6WBX8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAD9BQ6WBX8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAD9BQ6WBX8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAD9BQ6WBX8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RAD9BQ6WBX8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAD9BQ6WBX8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAD9BQ6WBX8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAD9BQ6WBX8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAD9BQ6WBX8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAD9BQ6WBX8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RAD9BQ6WBX8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAD9BQ6WBX8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD9BQ6WBX8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD9BQ6WBX8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD9BQ6WBX8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD9BQ6WBX8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD9BQ6WBX8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD9BQ6WBX8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAD9BQ6WBX8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAD9BQ6WBX8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD9BQ6WBX8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD9BQ6WBX8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD9BQ6WBX8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD9BQ6WBX8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD9BQ6WBX8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD9BQ6WBX8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD9BQ6WBX8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD9BQ6WBX8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD9BQ6WBX8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD9BQ6WBX8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD9BQ6WBX8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD9BQ6WBX8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD9BQ6WBX8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD9BQ6WBX8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD9BQ6WBX8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms