Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW01

CBLN3, Cerebellin-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3Q6UW01 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBLN3Q6UW01 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBLN3Q6UW01 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBLN3Q6UW01 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBLN3Q6UW01 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBLN3Q6UW01 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CBLN3Q6UW01 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBLN3Q6UW01 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBLN3Q6UW01 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBLN3Q6UW01 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBLN3Q6UW01 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBLN3Q6UW01 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBLN3Q6UW01 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBLN3Q6UW01 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CBLN3Q6UW01 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBLN3Q6UW01 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBLN3Q6UW01 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBLN3Q6UW01 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBLN3Q6UW01 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CBLN3Q6UW01 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CBLN3Q6UW01 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CBLN3Q6UW01 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBLN3Q6UW01 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBLN3Q6UW01 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBLN3Q6UW01 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBLN3Q6UW01 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBLN3Q6UW01 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBLN3Q6UW01 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBLN3Q6UW01 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBLN3Q6UW01 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBLN3Q6UW01 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBLN3Q6UW01 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBLN3Q6UW01 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBLN3Q6UW01 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBLN3Q6UW01 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBLN3Q6UW01 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBLN3Q6UW01 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CBLN3Q6UW01 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBLN3Q6UW01 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBLN3Q6UW01 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBLN3Q6UW01 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBLN3Q6UW01 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBLN3Q6UW01 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CBLN3Q6UW01 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBLN3Q6UW01 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBLN3Q6UW01 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBLN3Q6UW01 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBLN3Q6UW01 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBLN3Q6UW01 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBLN3Q6UW01 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBLN3Q6UW01 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBLN3Q6UW01 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBLN3Q6UW01 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBLN3Q6UW01 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBLN3Q6UW01 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CBLN3Q6UW01 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBLN3Q6UW01 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBLN3Q6UW01 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBLN3Q6UW01 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBLN3Q6UW01 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBLN3Q6UW01 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBLN3Q6UW01 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBLN3Q6UW01 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CBLN3Q6UW01 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBLN3Q6UW01 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBLN3Q6UW01 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBLN3Q6UW01 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBLN3Q6UW01 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBLN3Q6UW01 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBLN3Q6UW01 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBLN3Q6UW01 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBLN3Q6UW01 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBLN3Q6UW01 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CBLN3Q6UW01 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBLN3Q6UW01 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBLN3Q6UW01 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBLN3Q6UW01 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBLN3Q6UW01 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBLN3Q6UW01 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBLN3Q6UW01 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBLN3Q6UW01 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBLN3Q6UW01 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBLN3Q6UW01 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBLN3Q6UW01 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBLN3Q6UW01 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBLN3Q6UW01 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBLN3Q6UW01 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBLN3Q6UW01 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CBLN3Q6UW01 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBLN3Q6UW01 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBLN3Q6UW01 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBLN3Q6UW01 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBLN3Q6UW01 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CBLN3Q6UW01 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBLN3Q6UW01 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBLN3Q6UW01 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBLN3Q6UW01 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBLN3Q6UW01 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBLN3Q6UW01 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBLN3Q6UW01 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms