Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNIP4Q6PIL6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNIP4Q6PIL6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNIP4Q6PIL6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNIP4Q6PIL6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNIP4Q6PIL6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNIP4Q6PIL6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNIP4Q6PIL6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNIP4Q6PIL6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNIP4Q6PIL6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNIP4Q6PIL6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNIP4Q6PIL6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNIP4Q6PIL6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNIP4Q6PIL6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNIP4Q6PIL6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNIP4Q6PIL6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KCNIP4Q6PIL6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNIP4Q6PIL6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms