Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL35Q6PF15 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL35Q6PF15 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL35Q6PF15 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL35Q6PF15 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL35Q6PF15 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL35Q6PF15 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL35Q6PF15 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL35Q6PF15 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL35Q6PF15 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL35Q6PF15 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL35Q6PF15 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL35Q6PF15 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL35Q6PF15 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL35Q6PF15 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL35Q6PF15 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL35Q6PF15 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KLHL35Q6PF15 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL35Q6PF15 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL35Q6PF15 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL35Q6PF15 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL35Q6PF15 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL35Q6PF15 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL35Q6PF15 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL35Q6PF15 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL35Q6PF15 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL35Q6PF15 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL35Q6PF15 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL35Q6PF15 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL35Q6PF15 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL35Q6PF15 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL35Q6PF15 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL35Q6PF15 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL35Q6PF15 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL35Q6PF15 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL35Q6PF15 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL35Q6PF15 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL35Q6PF15 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL35Q6PF15 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL35Q6PF15 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL35Q6PF15 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL35Q6PF15 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL35Q6PF15 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL35Q6PF15 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL35Q6PF15 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL35Q6PF15 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL35Q6PF15 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL35Q6PF15 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL35Q6PF15 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL35Q6PF15 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL35Q6PF15 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL35Q6PF15 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL35Q6PF15 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL35Q6PF15 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL35Q6PF15 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL35Q6PF15 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL35Q6PF15 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL35Q6PF15 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL35Q6PF15 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL35Q6PF15 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL35Q6PF15 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL35Q6PF15 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL35Q6PF15 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL35Q6PF15 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL35Q6PF15 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL35Q6PF15 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL35Q6PF15 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL35Q6PF15 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL35Q6PF15 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL35Q6PF15 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL35Q6PF15 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL35Q6PF15 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL35Q6PF15 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL35Q6PF15 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL35Q6PF15 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL35Q6PF15 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL35Q6PF15 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL35Q6PF15 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL35Q6PF15 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL35Q6PF15 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL35Q6PF15 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL35Q6PF15 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL35Q6PF15 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL35Q6PF15 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL35Q6PF15 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL35Q6PF15 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL35Q6PF15 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL35Q6PF15 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL35Q6PF15 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL35Q6PF15 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL35Q6PF15 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL35Q6PF15 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL35Q6PF15 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL35Q6PF15 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL35Q6PF15 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL35Q6PF15 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL35Q6PF15 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL35Q6PF15 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL35Q6PF15 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL35Q6PF15 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms