Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4H8

FAM173B, Protein FAM173B, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM173BQ6P4H8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM173BQ6P4H8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM173BQ6P4H8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM173BQ6P4H8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM173BQ6P4H8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM173BQ6P4H8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM173BQ6P4H8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM173BQ6P4H8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM173BQ6P4H8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FAM173BQ6P4H8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FAM173BQ6P4H8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FAM173BQ6P4H8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FAM173BQ6P4H8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FAM173BQ6P4H8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FAM173BQ6P4H8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FAM173BQ6P4H8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
FAM173BQ6P4H8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FAM173BQ6P4H8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
FAM173BQ6P4H8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM173BQ6P4H8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM173BQ6P4H8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM173BQ6P4H8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM173BQ6P4H8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM173BQ6P4H8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM173BQ6P4H8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM173BQ6P4H8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM173BQ6P4H8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM173BQ6P4H8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM173BQ6P4H8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM173BQ6P4H8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM173BQ6P4H8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM173BQ6P4H8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM173BQ6P4H8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM173BQ6P4H8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM173BQ6P4H8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM173BQ6P4H8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM173BQ6P4H8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM173BQ6P4H8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM173BQ6P4H8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM173BQ6P4H8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM173BQ6P4H8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM173BQ6P4H8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM173BQ6P4H8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM173BQ6P4H8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM173BQ6P4H8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM173BQ6P4H8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM173BQ6P4H8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM173BQ6P4H8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM173BQ6P4H8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM173BQ6P4H8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM173BQ6P4H8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM173BQ6P4H8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM173BQ6P4H8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM173BQ6P4H8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM173BQ6P4H8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FAM173BQ6P4H8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FAM173BQ6P4H8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM173BQ6P4H8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM173BQ6P4H8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM173BQ6P4H8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM173BQ6P4H8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM173BQ6P4H8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM173BQ6P4H8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM173BQ6P4H8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM173BQ6P4H8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM173BQ6P4H8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM173BQ6P4H8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM173BQ6P4H8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM173BQ6P4H8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM173BQ6P4H8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM173BQ6P4H8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM173BQ6P4H8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FAM173BQ6P4H8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FAM173BQ6P4H8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FAM173BQ6P4H8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM173BQ6P4H8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM173BQ6P4H8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM173BQ6P4H8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM173BQ6P4H8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM173BQ6P4H8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM173BQ6P4H8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FAM173BQ6P4H8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
FAM173BQ6P4H8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FAM173BQ6P4H8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FAM173BQ6P4H8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FAM173BQ6P4H8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FAM173BQ6P4H8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FAM173BQ6P4H8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FAM173BQ6P4H8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FAM173BQ6P4H8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM173BQ6P4H8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM173BQ6P4H8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM173BQ6P4H8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM173BQ6P4H8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM173BQ6P4H8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM173BQ6P4H8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM173BQ6P4H8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM173BQ6P4H8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM173BQ6P4H8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM173BQ6P4H8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms