Protein–RNA interactions for Protein: Q6NYC8

PPP1R18, Phostensin, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R18Q6NYC8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PPP1R18Q6NYC8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPP1R18Q6NYC8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPP1R18Q6NYC8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPP1R18Q6NYC8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP1R18Q6NYC8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP1R18Q6NYC8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP1R18Q6NYC8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP1R18Q6NYC8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP1R18Q6NYC8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPP1R18Q6NYC8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPP1R18Q6NYC8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPP1R18Q6NYC8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPP1R18Q6NYC8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPP1R18Q6NYC8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPP1R18Q6NYC8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPP1R18Q6NYC8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPP1R18Q6NYC8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPP1R18Q6NYC8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPP1R18Q6NYC8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPP1R18Q6NYC8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPP1R18Q6NYC8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PPP1R18Q6NYC8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPP1R18Q6NYC8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPP1R18Q6NYC8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPP1R18Q6NYC8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPP1R18Q6NYC8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPP1R18Q6NYC8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPP1R18Q6NYC8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPP1R18Q6NYC8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPP1R18Q6NYC8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPP1R18Q6NYC8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPP1R18Q6NYC8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPP1R18Q6NYC8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPP1R18Q6NYC8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPP1R18Q6NYC8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPP1R18Q6NYC8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPP1R18Q6NYC8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPP1R18Q6NYC8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPP1R18Q6NYC8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPP1R18Q6NYC8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPP1R18Q6NYC8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPP1R18Q6NYC8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PPP1R18Q6NYC8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPP1R18Q6NYC8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPP1R18Q6NYC8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPP1R18Q6NYC8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPP1R18Q6NYC8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPP1R18Q6NYC8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPP1R18Q6NYC8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPP1R18Q6NYC8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPP1R18Q6NYC8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PPP1R18Q6NYC8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPP1R18Q6NYC8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPP1R18Q6NYC8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPP1R18Q6NYC8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPP1R18Q6NYC8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPP1R18Q6NYC8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPP1R18Q6NYC8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPP1R18Q6NYC8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPP1R18Q6NYC8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
PPP1R18Q6NYC8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPP1R18Q6NYC8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PPP1R18Q6NYC8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPP1R18Q6NYC8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPP1R18Q6NYC8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPP1R18Q6NYC8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPP1R18Q6NYC8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PPP1R18Q6NYC8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPP1R18Q6NYC8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPP1R18Q6NYC8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPP1R18Q6NYC8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPP1R18Q6NYC8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP1R18Q6NYC8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP1R18Q6NYC8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP1R18Q6NYC8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP1R18Q6NYC8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP1R18Q6NYC8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP1R18Q6NYC8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP1R18Q6NYC8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP1R18Q6NYC8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP1R18Q6NYC8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP1R18Q6NYC8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP1R18Q6NYC8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP1R18Q6NYC8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP1R18Q6NYC8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP1R18Q6NYC8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPP1R18Q6NYC8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPP1R18Q6NYC8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPP1R18Q6NYC8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPP1R18Q6NYC8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPP1R18Q6NYC8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPP1R18Q6NYC8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PPP1R18Q6NYC8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP1R18Q6NYC8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP1R18Q6NYC8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP1R18Q6NYC8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP1R18Q6NYC8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPP1R18Q6NYC8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPP1R18Q6NYC8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms