Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXR0

IRGC, Interferon-inducible GTPase 5, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGCQ6NXR0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRGCQ6NXR0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRGCQ6NXR0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRGCQ6NXR0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRGCQ6NXR0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRGCQ6NXR0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRGCQ6NXR0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRGCQ6NXR0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRGCQ6NXR0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRGCQ6NXR0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IRGCQ6NXR0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IRGCQ6NXR0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IRGCQ6NXR0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IRGCQ6NXR0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IRGCQ6NXR0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
IRGCQ6NXR0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IRGCQ6NXR0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRGCQ6NXR0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRGCQ6NXR0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRGCQ6NXR0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRGCQ6NXR0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRGCQ6NXR0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRGCQ6NXR0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRGCQ6NXR0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
IRGCQ6NXR0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRGCQ6NXR0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRGCQ6NXR0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRGCQ6NXR0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRGCQ6NXR0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRGCQ6NXR0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRGCQ6NXR0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRGCQ6NXR0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRGCQ6NXR0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
IRGCQ6NXR0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRGCQ6NXR0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRGCQ6NXR0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRGCQ6NXR0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRGCQ6NXR0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRGCQ6NXR0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRGCQ6NXR0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRGCQ6NXR0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRGCQ6NXR0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRGCQ6NXR0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRGCQ6NXR0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRGCQ6NXR0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRGCQ6NXR0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRGCQ6NXR0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRGCQ6NXR0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IRGCQ6NXR0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRGCQ6NXR0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRGCQ6NXR0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRGCQ6NXR0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRGCQ6NXR0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRGCQ6NXR0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRGCQ6NXR0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
IRGCQ6NXR0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRGCQ6NXR0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRGCQ6NXR0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRGCQ6NXR0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRGCQ6NXR0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRGCQ6NXR0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRGCQ6NXR0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRGCQ6NXR0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRGCQ6NXR0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRGCQ6NXR0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRGCQ6NXR0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRGCQ6NXR0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRGCQ6NXR0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRGCQ6NXR0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRGCQ6NXR0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRGCQ6NXR0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRGCQ6NXR0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRGCQ6NXR0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRGCQ6NXR0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRGCQ6NXR0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
IRGCQ6NXR0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRGCQ6NXR0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
IRGCQ6NXR0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRGCQ6NXR0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRGCQ6NXR0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRGCQ6NXR0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRGCQ6NXR0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRGCQ6NXR0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRGCQ6NXR0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRGCQ6NXR0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRGCQ6NXR0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRGCQ6NXR0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRGCQ6NXR0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRGCQ6NXR0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRGCQ6NXR0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRGCQ6NXR0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRGCQ6NXR0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRGCQ6NXR0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRGCQ6NXR0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRGCQ6NXR0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRGCQ6NXR0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRGCQ6NXR0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IRGCQ6NXR0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IRGCQ6NXR0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRGCQ6NXR0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms