Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUM9

RETSAT, All-trans-retinol 13,14-reductase, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETSATQ6NUM9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RETSATQ6NUM9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RETSATQ6NUM9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RETSATQ6NUM9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RETSATQ6NUM9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RETSATQ6NUM9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RETSATQ6NUM9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RETSATQ6NUM9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RETSATQ6NUM9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RETSATQ6NUM9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RETSATQ6NUM9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RETSATQ6NUM9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RETSATQ6NUM9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RETSATQ6NUM9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RETSATQ6NUM9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RETSATQ6NUM9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RETSATQ6NUM9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RETSATQ6NUM9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RETSATQ6NUM9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RETSATQ6NUM9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RETSATQ6NUM9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RETSATQ6NUM9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RETSATQ6NUM9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RETSATQ6NUM9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RETSATQ6NUM9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RETSATQ6NUM9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RETSATQ6NUM9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RETSATQ6NUM9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RETSATQ6NUM9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RETSATQ6NUM9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RETSATQ6NUM9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RETSATQ6NUM9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RETSATQ6NUM9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RETSATQ6NUM9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RETSATQ6NUM9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RETSATQ6NUM9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RETSATQ6NUM9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RETSATQ6NUM9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RETSATQ6NUM9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RETSATQ6NUM9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RETSATQ6NUM9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RETSATQ6NUM9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RETSATQ6NUM9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RETSATQ6NUM9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RETSATQ6NUM9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RETSATQ6NUM9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RETSATQ6NUM9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RETSATQ6NUM9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RETSATQ6NUM9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RETSATQ6NUM9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RETSATQ6NUM9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RETSATQ6NUM9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RETSATQ6NUM9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RETSATQ6NUM9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RETSATQ6NUM9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RETSATQ6NUM9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RETSATQ6NUM9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RETSATQ6NUM9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RETSATQ6NUM9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RETSATQ6NUM9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RETSATQ6NUM9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RETSATQ6NUM9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RETSATQ6NUM9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RETSATQ6NUM9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RETSATQ6NUM9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RETSATQ6NUM9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RETSATQ6NUM9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RETSATQ6NUM9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RETSATQ6NUM9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RETSATQ6NUM9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RETSATQ6NUM9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RETSATQ6NUM9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RETSATQ6NUM9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RETSATQ6NUM9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RETSATQ6NUM9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RETSATQ6NUM9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RETSATQ6NUM9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RETSATQ6NUM9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RETSATQ6NUM9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RETSATQ6NUM9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RETSATQ6NUM9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RETSATQ6NUM9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RETSATQ6NUM9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RETSATQ6NUM9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RETSATQ6NUM9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RETSATQ6NUM9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RETSATQ6NUM9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RETSATQ6NUM9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RETSATQ6NUM9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RETSATQ6NUM9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RETSATQ6NUM9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RETSATQ6NUM9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RETSATQ6NUM9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RETSATQ6NUM9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RETSATQ6NUM9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RETSATQ6NUM9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RETSATQ6NUM9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RETSATQ6NUM9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RETSATQ6NUM9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RETSATQ6NUM9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1013.6 ms