Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NANOGP8Q6NSW7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NANOGP8Q6NSW7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NANOGP8Q6NSW7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NANOGP8Q6NSW7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NANOGP8Q6NSW7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NANOGP8Q6NSW7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NANOGP8Q6NSW7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NANOGP8Q6NSW7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NANOGP8Q6NSW7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NANOGP8Q6NSW7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NANOGP8Q6NSW7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NANOGP8Q6NSW7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NANOGP8Q6NSW7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NANOGP8Q6NSW7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NANOGP8Q6NSW7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NANOGP8Q6NSW7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NANOGP8Q6NSW7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NANOGP8Q6NSW7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NANOGP8Q6NSW7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NANOGP8Q6NSW7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NANOGP8Q6NSW7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NANOGP8Q6NSW7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NANOGP8Q6NSW7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NANOGP8Q6NSW7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NANOGP8Q6NSW7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NANOGP8Q6NSW7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NANOGP8Q6NSW7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NANOGP8Q6NSW7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NANOGP8Q6NSW7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NANOGP8Q6NSW7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NANOGP8Q6NSW7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NANOGP8Q6NSW7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NANOGP8Q6NSW7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NANOGP8Q6NSW7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NANOGP8Q6NSW7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NANOGP8Q6NSW7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NANOGP8Q6NSW7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NANOGP8Q6NSW7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NANOGP8Q6NSW7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NANOGP8Q6NSW7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NANOGP8Q6NSW7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NANOGP8Q6NSW7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NANOGP8Q6NSW7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NANOGP8Q6NSW7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NANOGP8Q6NSW7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NANOGP8Q6NSW7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NANOGP8Q6NSW7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NANOGP8Q6NSW7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NANOGP8Q6NSW7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NANOGP8Q6NSW7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NANOGP8Q6NSW7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NANOGP8Q6NSW7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NANOGP8Q6NSW7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NANOGP8Q6NSW7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NANOGP8Q6NSW7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NANOGP8Q6NSW7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NANOGP8Q6NSW7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NANOGP8Q6NSW7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NANOGP8Q6NSW7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NANOGP8Q6NSW7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NANOGP8Q6NSW7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NANOGP8Q6NSW7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NANOGP8Q6NSW7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NANOGP8Q6NSW7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NANOGP8Q6NSW7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NANOGP8Q6NSW7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NANOGP8Q6NSW7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NANOGP8Q6NSW7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NANOGP8Q6NSW7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NANOGP8Q6NSW7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NANOGP8Q6NSW7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NANOGP8Q6NSW7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NANOGP8Q6NSW7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NANOGP8Q6NSW7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NANOGP8Q6NSW7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NANOGP8Q6NSW7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NANOGP8Q6NSW7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NANOGP8Q6NSW7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NANOGP8Q6NSW7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NANOGP8Q6NSW7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NANOGP8Q6NSW7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NANOGP8Q6NSW7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NANOGP8Q6NSW7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NANOGP8Q6NSW7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NANOGP8Q6NSW7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.9 ms