Protein–RNA interactions for Protein: Q6H8Q1

ABLIM2, Actin-binding LIM protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABLIM2Q6H8Q1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABLIM2Q6H8Q1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ABLIM2Q6H8Q1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ABLIM2Q6H8Q1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABLIM2Q6H8Q1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABLIM2Q6H8Q1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABLIM2Q6H8Q1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABLIM2Q6H8Q1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABLIM2Q6H8Q1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABLIM2Q6H8Q1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABLIM2Q6H8Q1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABLIM2Q6H8Q1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABLIM2Q6H8Q1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ABLIM2Q6H8Q1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABLIM2Q6H8Q1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABLIM2Q6H8Q1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABLIM2Q6H8Q1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABLIM2Q6H8Q1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABLIM2Q6H8Q1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABLIM2Q6H8Q1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABLIM2Q6H8Q1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms