Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC9A4Q6AI14 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC9A4Q6AI14 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC9A4Q6AI14 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC9A4Q6AI14 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC9A4Q6AI14 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC9A4Q6AI14 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9A4Q6AI14 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9A4Q6AI14 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9A4Q6AI14 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9A4Q6AI14 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9A4Q6AI14 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9A4Q6AI14 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9A4Q6AI14 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9A4Q6AI14 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9A4Q6AI14 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9A4Q6AI14 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9A4Q6AI14 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9A4Q6AI14 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9A4Q6AI14 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9A4Q6AI14 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9A4Q6AI14 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9A4Q6AI14 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9A4Q6AI14 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9A4Q6AI14 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9A4Q6AI14 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9A4Q6AI14 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9A4Q6AI14 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9A4Q6AI14 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9A4Q6AI14 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A4Q6AI14 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A4Q6AI14 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A4Q6AI14 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A4Q6AI14 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A4Q6AI14 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A4Q6AI14 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A4Q6AI14 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A4Q6AI14 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A4Q6AI14 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A4Q6AI14 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9A4Q6AI14 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9A4Q6AI14 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9A4Q6AI14 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9A4Q6AI14 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9A4Q6AI14 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A4Q6AI14 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A4Q6AI14 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9A4Q6AI14 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9A4Q6AI14 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9A4Q6AI14 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9A4Q6AI14 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9A4Q6AI14 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9A4Q6AI14 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9A4Q6AI14 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9A4Q6AI14 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9A4Q6AI14 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9A4Q6AI14 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9A4Q6AI14 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9A4Q6AI14 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9A4Q6AI14 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9A4Q6AI14 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9A4Q6AI14 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9A4Q6AI14 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9A4Q6AI14 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9A4Q6AI14 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9A4Q6AI14 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9A4Q6AI14 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9A4Q6AI14 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9A4Q6AI14 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9A4Q6AI14 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9A4Q6AI14 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9A4Q6AI14 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9A4Q6AI14 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9A4Q6AI14 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9A4Q6AI14 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9A4Q6AI14 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9A4Q6AI14 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9A4Q6AI14 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9A4Q6AI14 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9A4Q6AI14 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9A4Q6AI14 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9A4Q6AI14 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9A4Q6AI14 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9A4Q6AI14 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9A4Q6AI14 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9A4Q6AI14 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9A4Q6AI14 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9A4Q6AI14 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9A4Q6AI14 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9A4Q6AI14 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9A4Q6AI14 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC9A4Q6AI14 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms