Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ANKRD40Q6AI12 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ANKRD40Q6AI12 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ANKRD40Q6AI12 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ANKRD40Q6AI12 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ANKRD40Q6AI12 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ANKRD40Q6AI12 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ANKRD40Q6AI12 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ANKRD40Q6AI12 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ANKRD40Q6AI12 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ANKRD40Q6AI12 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ANKRD40Q6AI12 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ANKRD40Q6AI12 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ANKRD40Q6AI12 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ANKRD40Q6AI12 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ANKRD40Q6AI12 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ANKRD40Q6AI12 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ANKRD40Q6AI12 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ANKRD40Q6AI12 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ANKRD40Q6AI12 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ANKRD40Q6AI12 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ANKRD40Q6AI12 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ANKRD40Q6AI12 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ANKRD40Q6AI12 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ANKRD40Q6AI12 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ANKRD40Q6AI12 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ANKRD40Q6AI12 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ANKRD40Q6AI12 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ANKRD40Q6AI12 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ANKRD40Q6AI12 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ANKRD40Q6AI12 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ANKRD40Q6AI12 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ANKRD40Q6AI12 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ANKRD40Q6AI12 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ANKRD40Q6AI12 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ANKRD40Q6AI12 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ANKRD40Q6AI12 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ANKRD40Q6AI12 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ANKRD40Q6AI12 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ANKRD40Q6AI12 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ANKRD40Q6AI12 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ANKRD40Q6AI12 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ANKRD40Q6AI12 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ANKRD40Q6AI12 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ANKRD40Q6AI12 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ANKRD40Q6AI12 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ANKRD40Q6AI12 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ANKRD40Q6AI12 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ANKRD40Q6AI12 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ANKRD40Q6AI12 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ANKRD40Q6AI12 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ANKRD40Q6AI12 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ANKRD40Q6AI12 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ANKRD40Q6AI12 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ANKRD40Q6AI12 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ANKRD40Q6AI12 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ANKRD40Q6AI12 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ANKRD40Q6AI12 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ANKRD40Q6AI12 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ANKRD40Q6AI12 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ANKRD40Q6AI12 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ANKRD40Q6AI12 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ANKRD40Q6AI12 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ANKRD40Q6AI12 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ANKRD40Q6AI12 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ANKRD40Q6AI12 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ANKRD40Q6AI12 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ANKRD40Q6AI12 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ANKRD40Q6AI12 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ANKRD40Q6AI12 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ANKRD40Q6AI12 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ANKRD40Q6AI12 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ANKRD40Q6AI12 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ANKRD40Q6AI12 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ANKRD40Q6AI12 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ANKRD40Q6AI12 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ANKRD40Q6AI12 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ANKRD40Q6AI12 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ANKRD40Q6AI12 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ANKRD40Q6AI12 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ANKRD40Q6AI12 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ANKRD40Q6AI12 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ANKRD40Q6AI12 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ANKRD40Q6AI12 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ANKRD40Q6AI12 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ANKRD40Q6AI12 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ANKRD40Q6AI12 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ANKRD40Q6AI12 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ANKRD40Q6AI12 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ANKRD40Q6AI12 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ANKRD40Q6AI12 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ANKRD40Q6AI12 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ANKRD40Q6AI12 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ANKRD40Q6AI12 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ANKRD40Q6AI12 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ANKRD40Q6AI12 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ANKRD40Q6AI12 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ANKRD40Q6AI12 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ANKRD40Q6AI12 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ANKRD40Q6AI12 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms