Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPECC1LQ69YQ0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPECC1LQ69YQ0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPECC1LQ69YQ0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPECC1LQ69YQ0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPECC1LQ69YQ0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPECC1LQ69YQ0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPECC1LQ69YQ0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPECC1LQ69YQ0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPECC1LQ69YQ0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPECC1LQ69YQ0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPECC1LQ69YQ0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPECC1LQ69YQ0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPECC1LQ69YQ0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPECC1LQ69YQ0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SPECC1LQ69YQ0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPECC1LQ69YQ0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPECC1LQ69YQ0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPECC1LQ69YQ0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPECC1LQ69YQ0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPECC1LQ69YQ0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPECC1LQ69YQ0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SPECC1LQ69YQ0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPECC1LQ69YQ0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SPECC1LQ69YQ0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPECC1LQ69YQ0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPECC1LQ69YQ0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPECC1LQ69YQ0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SPECC1LQ69YQ0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPECC1LQ69YQ0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPECC1LQ69YQ0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPECC1LQ69YQ0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPECC1LQ69YQ0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPECC1LQ69YQ0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPECC1LQ69YQ0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPECC1LQ69YQ0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPECC1LQ69YQ0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPECC1LQ69YQ0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPECC1LQ69YQ0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPECC1LQ69YQ0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPECC1LQ69YQ0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPECC1LQ69YQ0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPECC1LQ69YQ0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPECC1LQ69YQ0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPECC1LQ69YQ0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPECC1LQ69YQ0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPECC1LQ69YQ0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPECC1LQ69YQ0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPECC1LQ69YQ0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPECC1LQ69YQ0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPECC1LQ69YQ0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPECC1LQ69YQ0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPECC1LQ69YQ0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPECC1LQ69YQ0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPECC1LQ69YQ0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPECC1LQ69YQ0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPECC1LQ69YQ0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPECC1LQ69YQ0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPECC1LQ69YQ0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPECC1LQ69YQ0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPECC1LQ69YQ0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPECC1LQ69YQ0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPECC1LQ69YQ0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPECC1LQ69YQ0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPECC1LQ69YQ0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPECC1LQ69YQ0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPECC1LQ69YQ0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPECC1LQ69YQ0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPECC1LQ69YQ0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPECC1LQ69YQ0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPECC1LQ69YQ0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPECC1LQ69YQ0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPECC1LQ69YQ0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SPECC1LQ69YQ0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPECC1LQ69YQ0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SPECC1LQ69YQ0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPECC1LQ69YQ0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPECC1LQ69YQ0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPECC1LQ69YQ0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SPECC1LQ69YQ0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SPECC1LQ69YQ0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPECC1LQ69YQ0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPECC1LQ69YQ0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPECC1LQ69YQ0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPECC1LQ69YQ0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPECC1LQ69YQ0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPECC1LQ69YQ0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPECC1LQ69YQ0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPECC1LQ69YQ0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPECC1LQ69YQ0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPECC1LQ69YQ0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPECC1LQ69YQ0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPECC1LQ69YQ0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPECC1LQ69YQ0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPECC1LQ69YQ0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPECC1LQ69YQ0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPECC1LQ69YQ0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SPECC1LQ69YQ0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPECC1LQ69YQ0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPECC1LQ69YQ0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms