Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALS2CLQ60I27 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALS2CLQ60I27 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALS2CLQ60I27 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALS2CLQ60I27 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALS2CLQ60I27 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALS2CLQ60I27 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALS2CLQ60I27 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALS2CLQ60I27 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALS2CLQ60I27 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ALS2CLQ60I27 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ALS2CLQ60I27 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALS2CLQ60I27 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALS2CLQ60I27 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALS2CLQ60I27 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALS2CLQ60I27 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALS2CLQ60I27 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ALS2CLQ60I27 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ALS2CLQ60I27 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ALS2CLQ60I27 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALS2CLQ60I27 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ALS2CLQ60I27 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALS2CLQ60I27 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALS2CLQ60I27 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALS2CLQ60I27 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALS2CLQ60I27 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALS2CLQ60I27 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALS2CLQ60I27 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALS2CLQ60I27 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALS2CLQ60I27 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALS2CLQ60I27 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALS2CLQ60I27 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALS2CLQ60I27 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALS2CLQ60I27 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALS2CLQ60I27 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALS2CLQ60I27 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALS2CLQ60I27 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALS2CLQ60I27 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALS2CLQ60I27 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALS2CLQ60I27 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALS2CLQ60I27 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALS2CLQ60I27 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALS2CLQ60I27 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALS2CLQ60I27 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALS2CLQ60I27 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALS2CLQ60I27 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALS2CLQ60I27 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALS2CLQ60I27 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALS2CLQ60I27 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ALS2CLQ60I27 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALS2CLQ60I27 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALS2CLQ60I27 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALS2CLQ60I27 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALS2CLQ60I27 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALS2CLQ60I27 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALS2CLQ60I27 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALS2CLQ60I27 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALS2CLQ60I27 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALS2CLQ60I27 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALS2CLQ60I27 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALS2CLQ60I27 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALS2CLQ60I27 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALS2CLQ60I27 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALS2CLQ60I27 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALS2CLQ60I27 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALS2CLQ60I27 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALS2CLQ60I27 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALS2CLQ60I27 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ALS2CLQ60I27 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ALS2CLQ60I27 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ALS2CLQ60I27 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ALS2CLQ60I27 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ALS2CLQ60I27 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ALS2CLQ60I27 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ALS2CLQ60I27 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ALS2CLQ60I27 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ALS2CLQ60I27 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALS2CLQ60I27 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALS2CLQ60I27 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2CLQ60I27 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2CLQ60I27 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2CLQ60I27 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2CLQ60I27 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2CLQ60I27 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALS2CLQ60I27 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALS2CLQ60I27 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ALS2CLQ60I27 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ALS2CLQ60I27 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALS2CLQ60I27 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALS2CLQ60I27 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALS2CLQ60I27 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALS2CLQ60I27 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALS2CLQ60I27 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALS2CLQ60I27 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALS2CLQ60I27 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALS2CLQ60I27 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALS2CLQ60I27 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALS2CLQ60I27 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALS2CLQ60I27 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALS2CLQ60I27 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms