Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PRAMEF18Q5VWM3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRAMEF18Q5VWM3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRAMEF18Q5VWM3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRAMEF18Q5VWM3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PRAMEF18Q5VWM3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRAMEF18Q5VWM3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRAMEF18Q5VWM3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRAMEF18Q5VWM3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRAMEF18Q5VWM3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRAMEF18Q5VWM3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRAMEF18Q5VWM3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRAMEF18Q5VWM3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRAMEF18Q5VWM3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRAMEF18Q5VWM3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRAMEF18Q5VWM3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRAMEF18Q5VWM3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRAMEF18Q5VWM3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRAMEF18Q5VWM3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PRAMEF18Q5VWM3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRAMEF18Q5VWM3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRAMEF18Q5VWM3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRAMEF18Q5VWM3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRAMEF18Q5VWM3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRAMEF18Q5VWM3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRAMEF18Q5VWM3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRAMEF18Q5VWM3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRAMEF18Q5VWM3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRAMEF18Q5VWM3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRAMEF18Q5VWM3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRAMEF18Q5VWM3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRAMEF18Q5VWM3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRAMEF18Q5VWM3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRAMEF18Q5VWM3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRAMEF18Q5VWM3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRAMEF18Q5VWM3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRAMEF18Q5VWM3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PRAMEF18Q5VWM3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRAMEF18Q5VWM3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PRAMEF18Q5VWM3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRAMEF18Q5VWM3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRAMEF18Q5VWM3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRAMEF18Q5VWM3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRAMEF18Q5VWM3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRAMEF18Q5VWM3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRAMEF18Q5VWM3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRAMEF18Q5VWM3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRAMEF18Q5VWM3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRAMEF18Q5VWM3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRAMEF18Q5VWM3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRAMEF18Q5VWM3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRAMEF18Q5VWM3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRAMEF18Q5VWM3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRAMEF18Q5VWM3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRAMEF18Q5VWM3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRAMEF18Q5VWM3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRAMEF18Q5VWM3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRAMEF18Q5VWM3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRAMEF18Q5VWM3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRAMEF18Q5VWM3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRAMEF18Q5VWM3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRAMEF18Q5VWM3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRAMEF18Q5VWM3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRAMEF18Q5VWM3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRAMEF18Q5VWM3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRAMEF18Q5VWM3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRAMEF18Q5VWM3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRAMEF18Q5VWM3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRAMEF18Q5VWM3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRAMEF18Q5VWM3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRAMEF18Q5VWM3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRAMEF18Q5VWM3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRAMEF18Q5VWM3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRAMEF18Q5VWM3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRAMEF18Q5VWM3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PRAMEF18Q5VWM3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRAMEF18Q5VWM3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRAMEF18Q5VWM3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRAMEF18Q5VWM3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRAMEF18Q5VWM3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRAMEF18Q5VWM3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRAMEF18Q5VWM3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRAMEF18Q5VWM3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRAMEF18Q5VWM3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRAMEF18Q5VWM3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRAMEF18Q5VWM3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRAMEF18Q5VWM3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRAMEF18Q5VWM3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRAMEF18Q5VWM3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRAMEF18Q5VWM3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRAMEF18Q5VWM3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRAMEF18Q5VWM3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRAMEF18Q5VWM3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms