Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUD6

FAM69B, Protein FAM69B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM69BQ5VUD6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM69BQ5VUD6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM69BQ5VUD6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM69BQ5VUD6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM69BQ5VUD6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM69BQ5VUD6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM69BQ5VUD6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM69BQ5VUD6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM69BQ5VUD6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM69BQ5VUD6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM69BQ5VUD6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM69BQ5VUD6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM69BQ5VUD6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM69BQ5VUD6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM69BQ5VUD6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM69BQ5VUD6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM69BQ5VUD6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM69BQ5VUD6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM69BQ5VUD6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM69BQ5VUD6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM69BQ5VUD6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM69BQ5VUD6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM69BQ5VUD6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM69BQ5VUD6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM69BQ5VUD6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM69BQ5VUD6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM69BQ5VUD6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM69BQ5VUD6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM69BQ5VUD6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM69BQ5VUD6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM69BQ5VUD6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM69BQ5VUD6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM69BQ5VUD6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM69BQ5VUD6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM69BQ5VUD6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM69BQ5VUD6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM69BQ5VUD6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM69BQ5VUD6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM69BQ5VUD6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM69BQ5VUD6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM69BQ5VUD6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM69BQ5VUD6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM69BQ5VUD6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM69BQ5VUD6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM69BQ5VUD6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM69BQ5VUD6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM69BQ5VUD6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM69BQ5VUD6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM69BQ5VUD6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM69BQ5VUD6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM69BQ5VUD6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM69BQ5VUD6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM69BQ5VUD6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM69BQ5VUD6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM69BQ5VUD6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM69BQ5VUD6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM69BQ5VUD6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM69BQ5VUD6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM69BQ5VUD6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM69BQ5VUD6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM69BQ5VUD6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM69BQ5VUD6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM69BQ5VUD6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM69BQ5VUD6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM69BQ5VUD6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM69BQ5VUD6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM69BQ5VUD6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM69BQ5VUD6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM69BQ5VUD6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM69BQ5VUD6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM69BQ5VUD6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM69BQ5VUD6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM69BQ5VUD6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM69BQ5VUD6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM69BQ5VUD6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM69BQ5VUD6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM69BQ5VUD6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM69BQ5VUD6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM69BQ5VUD6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM69BQ5VUD6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM69BQ5VUD6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM69BQ5VUD6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM69BQ5VUD6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM69BQ5VUD6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM69BQ5VUD6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM69BQ5VUD6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM69BQ5VUD6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM69BQ5VUD6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM69BQ5VUD6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM69BQ5VUD6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM69BQ5VUD6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM69BQ5VUD6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM69BQ5VUD6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM69BQ5VUD6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM69BQ5VUD6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM69BQ5VUD6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM69BQ5VUD6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM69BQ5VUD6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM69BQ5VUD6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM69BQ5VUD6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms