Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIF1Q5UIP0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIF1Q5UIP0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RIF1Q5UIP0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIF1Q5UIP0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIF1Q5UIP0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIF1Q5UIP0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIF1Q5UIP0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIF1Q5UIP0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIF1Q5UIP0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIF1Q5UIP0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIF1Q5UIP0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIF1Q5UIP0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIF1Q5UIP0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIF1Q5UIP0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIF1Q5UIP0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIF1Q5UIP0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIF1Q5UIP0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIF1Q5UIP0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIF1Q5UIP0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIF1Q5UIP0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIF1Q5UIP0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIF1Q5UIP0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RIF1Q5UIP0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIF1Q5UIP0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIF1Q5UIP0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIF1Q5UIP0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIF1Q5UIP0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIF1Q5UIP0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIF1Q5UIP0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIF1Q5UIP0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIF1Q5UIP0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIF1Q5UIP0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIF1Q5UIP0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIF1Q5UIP0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIF1Q5UIP0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIF1Q5UIP0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIF1Q5UIP0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIF1Q5UIP0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIF1Q5UIP0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIF1Q5UIP0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIF1Q5UIP0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIF1Q5UIP0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIF1Q5UIP0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIF1Q5UIP0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIF1Q5UIP0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIF1Q5UIP0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIF1Q5UIP0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RIF1Q5UIP0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIF1Q5UIP0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIF1Q5UIP0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIF1Q5UIP0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIF1Q5UIP0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIF1Q5UIP0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIF1Q5UIP0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIF1Q5UIP0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIF1Q5UIP0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RIF1Q5UIP0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RIF1Q5UIP0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RIF1Q5UIP0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIF1Q5UIP0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIF1Q5UIP0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIF1Q5UIP0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIF1Q5UIP0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIF1Q5UIP0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIF1Q5UIP0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIF1Q5UIP0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIF1Q5UIP0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIF1Q5UIP0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIF1Q5UIP0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIF1Q5UIP0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIF1Q5UIP0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIF1Q5UIP0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIF1Q5UIP0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIF1Q5UIP0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIF1Q5UIP0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIF1Q5UIP0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIF1Q5UIP0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIF1Q5UIP0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIF1Q5UIP0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RIF1Q5UIP0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIF1Q5UIP0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIF1Q5UIP0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RIF1Q5UIP0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIF1Q5UIP0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIF1Q5UIP0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIF1Q5UIP0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RIF1Q5UIP0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIF1Q5UIP0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIF1Q5UIP0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIF1Q5UIP0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIF1Q5UIP0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIF1Q5UIP0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIF1Q5UIP0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RIF1Q5UIP0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIF1Q5UIP0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIF1Q5UIP0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIF1Q5UIP0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIF1Q5UIP0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIF1Q5UIP0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms