Protein–RNA interactions for Protein: Q5TG30

ARHGAP40, Rho GTPase-activating protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP40Q5TG30 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP40Q5TG30 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP40Q5TG30 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP40Q5TG30 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP40Q5TG30 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP40Q5TG30 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP40Q5TG30 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGAP40Q5TG30 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGAP40Q5TG30 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGAP40Q5TG30 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGAP40Q5TG30 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGAP40Q5TG30 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGAP40Q5TG30 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARHGAP40Q5TG30 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARHGAP40Q5TG30 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP40Q5TG30 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP40Q5TG30 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP40Q5TG30 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP40Q5TG30 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP40Q5TG30 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP40Q5TG30 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP40Q5TG30 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP40Q5TG30 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP40Q5TG30 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP40Q5TG30 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP40Q5TG30 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP40Q5TG30 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP40Q5TG30 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP40Q5TG30 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP40Q5TG30 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP40Q5TG30 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP40Q5TG30 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP40Q5TG30 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP40Q5TG30 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP40Q5TG30 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP40Q5TG30 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP40Q5TG30 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGAP40Q5TG30 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGAP40Q5TG30 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGAP40Q5TG30 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGAP40Q5TG30 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGAP40Q5TG30 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGAP40Q5TG30 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGAP40Q5TG30 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGAP40Q5TG30 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGAP40Q5TG30 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGAP40Q5TG30 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGAP40Q5TG30 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGAP40Q5TG30 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGAP40Q5TG30 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGAP40Q5TG30 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGAP40Q5TG30 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGAP40Q5TG30 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGAP40Q5TG30 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGAP40Q5TG30 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGAP40Q5TG30 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGAP40Q5TG30 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGAP40Q5TG30 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGAP40Q5TG30 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGAP40Q5TG30 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP40Q5TG30 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP40Q5TG30 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP40Q5TG30 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP40Q5TG30 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP40Q5TG30 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP40Q5TG30 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP40Q5TG30 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP40Q5TG30 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGAP40Q5TG30 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGAP40Q5TG30 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGAP40Q5TG30 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP40Q5TG30 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP40Q5TG30 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP40Q5TG30 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP40Q5TG30 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP40Q5TG30 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP40Q5TG30 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP40Q5TG30 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP40Q5TG30 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARHGAP40Q5TG30 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARHGAP40Q5TG30 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARHGAP40Q5TG30 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP40Q5TG30 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP40Q5TG30 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP40Q5TG30 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP40Q5TG30 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP40Q5TG30 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP40Q5TG30 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP40Q5TG30 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP40Q5TG30 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP40Q5TG30 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP40Q5TG30 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP40Q5TG30 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP40Q5TG30 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP40Q5TG30 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP40Q5TG30 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP40Q5TG30 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP40Q5TG30 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP40Q5TG30 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP40Q5TG30 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms