Protein–RNA interactions for Protein: Q5T200

ZC3H13, Zinc finger CCCH domain-containing protein 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H13Q5T200 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ZC3H13Q5T200 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
ZC3H13Q5T200 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ZC3H13Q5T200 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ZC3H13Q5T200 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
ZC3H13Q5T200 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
ZC3H13Q5T200 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ZC3H13Q5T200 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
ZC3H13Q5T200 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ZC3H13Q5T200 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ZC3H13Q5T200 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.42
ZC3H13Q5T200 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ZC3H13Q5T200 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ZC3H13Q5T200 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ZC3H13Q5T200 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ZC3H13Q5T200 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ZC3H13Q5T200 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ZC3H13Q5T200 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ZC3H13Q5T200 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ZC3H13Q5T200 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ZC3H13Q5T200 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ZC3H13Q5T200 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
ZC3H13Q5T200 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ZC3H13Q5T200 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ZC3H13Q5T200 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ZC3H13Q5T200 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ZC3H13Q5T200 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ZC3H13Q5T200 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
ZC3H13Q5T200 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ZC3H13Q5T200 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ZC3H13Q5T200 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
ZC3H13Q5T200 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ZC3H13Q5T200 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ZC3H13Q5T200 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ZC3H13Q5T200 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ZC3H13Q5T200 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ZC3H13Q5T200 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ZC3H13Q5T200 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ZC3H13Q5T200 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ZC3H13Q5T200 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
ZC3H13Q5T200 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ZC3H13Q5T200 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ZC3H13Q5T200 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ZC3H13Q5T200 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ZC3H13Q5T200 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ZC3H13Q5T200 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ZC3H13Q5T200 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ZC3H13Q5T200 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ZC3H13Q5T200 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ZC3H13Q5T200 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ZC3H13Q5T200 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
ZC3H13Q5T200 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
ZC3H13Q5T200 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
ZC3H13Q5T200 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ZC3H13Q5T200 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ZC3H13Q5T200 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
ZC3H13Q5T200 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
ZC3H13Q5T200 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
ZC3H13Q5T200 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
ZC3H13Q5T200 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ZC3H13Q5T200 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
ZC3H13Q5T200 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
ZC3H13Q5T200 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
ZC3H13Q5T200 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
ZC3H13Q5T200 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.3■■■■□ 3.4
ZC3H13Q5T200 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ZC3H13Q5T200 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ZC3H13Q5T200 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ZC3H13Q5T200 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ZC3H13Q5T200 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ZC3H13Q5T200 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ZC3H13Q5T200 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ZC3H13Q5T200 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ZC3H13Q5T200 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ZC3H13Q5T200 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ZC3H13Q5T200 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ZC3H13Q5T200 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ZC3H13Q5T200 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ZC3H13Q5T200 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ZC3H13Q5T200 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
ZC3H13Q5T200 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
ZC3H13Q5T200 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ZC3H13Q5T200 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ZC3H13Q5T200 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ZC3H13Q5T200 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ZC3H13Q5T200 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ZC3H13Q5T200 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ZC3H13Q5T200 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ZC3H13Q5T200 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ZC3H13Q5T200 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ZC3H13Q5T200 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ZC3H13Q5T200 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ZC3H13Q5T200 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ZC3H13Q5T200 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ZC3H13Q5T200 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ZC3H13Q5T200 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ZC3H13Q5T200 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ZC3H13Q5T200 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ZC3H13Q5T200 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ZC3H13Q5T200 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms