Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC122Q5T0U0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC122Q5T0U0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC122Q5T0U0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC122Q5T0U0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC122Q5T0U0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC122Q5T0U0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC122Q5T0U0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC122Q5T0U0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC122Q5T0U0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC122Q5T0U0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC122Q5T0U0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC122Q5T0U0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC122Q5T0U0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC122Q5T0U0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC122Q5T0U0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC122Q5T0U0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC122Q5T0U0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC122Q5T0U0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC122Q5T0U0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC122Q5T0U0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC122Q5T0U0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC122Q5T0U0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC122Q5T0U0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC122Q5T0U0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC122Q5T0U0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC122Q5T0U0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC122Q5T0U0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC122Q5T0U0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC122Q5T0U0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC122Q5T0U0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC122Q5T0U0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC122Q5T0U0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC122Q5T0U0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC122Q5T0U0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC122Q5T0U0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC122Q5T0U0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC122Q5T0U0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC122Q5T0U0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC122Q5T0U0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC122Q5T0U0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC122Q5T0U0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC122Q5T0U0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC122Q5T0U0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC122Q5T0U0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC122Q5T0U0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC122Q5T0U0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC122Q5T0U0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC122Q5T0U0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC122Q5T0U0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC122Q5T0U0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC122Q5T0U0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC122Q5T0U0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC122Q5T0U0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC122Q5T0U0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC122Q5T0U0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC122Q5T0U0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms