Protein–RNA interactions for Protein: Q5T035

C9orf129, Putative uncharacterized protein C9orf129, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf129Q5T035 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf129Q5T035 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf129Q5T035 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf129Q5T035 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf129Q5T035 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf129Q5T035 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf129Q5T035 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf129Q5T035 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf129Q5T035 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf129Q5T035 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms