Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM1

ZNF678, Zinc finger protein 678, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF678Q5SXM1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF678Q5SXM1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF678Q5SXM1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF678Q5SXM1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF678Q5SXM1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF678Q5SXM1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF678Q5SXM1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF678Q5SXM1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF678Q5SXM1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF678Q5SXM1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF678Q5SXM1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF678Q5SXM1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF678Q5SXM1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF678Q5SXM1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF678Q5SXM1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF678Q5SXM1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF678Q5SXM1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF678Q5SXM1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF678Q5SXM1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF678Q5SXM1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF678Q5SXM1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF678Q5SXM1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF678Q5SXM1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF678Q5SXM1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF678Q5SXM1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF678Q5SXM1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF678Q5SXM1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF678Q5SXM1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF678Q5SXM1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF678Q5SXM1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF678Q5SXM1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF678Q5SXM1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF678Q5SXM1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF678Q5SXM1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF678Q5SXM1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF678Q5SXM1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF678Q5SXM1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF678Q5SXM1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF678Q5SXM1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF678Q5SXM1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF678Q5SXM1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF678Q5SXM1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF678Q5SXM1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF678Q5SXM1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF678Q5SXM1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF678Q5SXM1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF678Q5SXM1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF678Q5SXM1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF678Q5SXM1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF678Q5SXM1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF678Q5SXM1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF678Q5SXM1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF678Q5SXM1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF678Q5SXM1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF678Q5SXM1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF678Q5SXM1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF678Q5SXM1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF678Q5SXM1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF678Q5SXM1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF678Q5SXM1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF678Q5SXM1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF678Q5SXM1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF678Q5SXM1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF678Q5SXM1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF678Q5SXM1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF678Q5SXM1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF678Q5SXM1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF678Q5SXM1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF678Q5SXM1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF678Q5SXM1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF678Q5SXM1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF678Q5SXM1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF678Q5SXM1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF678Q5SXM1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF678Q5SXM1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF678Q5SXM1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF678Q5SXM1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF678Q5SXM1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF678Q5SXM1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF678Q5SXM1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF678Q5SXM1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF678Q5SXM1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF678Q5SXM1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF678Q5SXM1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF678Q5SXM1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF678Q5SXM1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF678Q5SXM1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF678Q5SXM1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF678Q5SXM1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF678Q5SXM1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF678Q5SXM1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF678Q5SXM1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF678Q5SXM1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF678Q5SXM1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF678Q5SXM1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF678Q5SXM1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF678Q5SXM1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF678Q5SXM1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF678Q5SXM1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF678Q5SXM1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 229.9 ms