Protein–RNA interactions for Protein: Q5MAI5

CDKL4, Cyclin-dependent kinase-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL4Q5MAI5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDKL4Q5MAI5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDKL4Q5MAI5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDKL4Q5MAI5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDKL4Q5MAI5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CDKL4Q5MAI5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDKL4Q5MAI5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKL4Q5MAI5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKL4Q5MAI5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKL4Q5MAI5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKL4Q5MAI5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKL4Q5MAI5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKL4Q5MAI5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKL4Q5MAI5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKL4Q5MAI5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKL4Q5MAI5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKL4Q5MAI5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKL4Q5MAI5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKL4Q5MAI5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKL4Q5MAI5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKL4Q5MAI5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKL4Q5MAI5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKL4Q5MAI5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKL4Q5MAI5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDKL4Q5MAI5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDKL4Q5MAI5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDKL4Q5MAI5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDKL4Q5MAI5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKL4Q5MAI5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKL4Q5MAI5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKL4Q5MAI5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKL4Q5MAI5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKL4Q5MAI5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDKL4Q5MAI5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDKL4Q5MAI5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDKL4Q5MAI5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDKL4Q5MAI5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDKL4Q5MAI5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CDKL4Q5MAI5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDKL4Q5MAI5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDKL4Q5MAI5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDKL4Q5MAI5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL4Q5MAI5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL4Q5MAI5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL4Q5MAI5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL4Q5MAI5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL4Q5MAI5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL4Q5MAI5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL4Q5MAI5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL4Q5MAI5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKL4Q5MAI5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKL4Q5MAI5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKL4Q5MAI5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKL4Q5MAI5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKL4Q5MAI5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKL4Q5MAI5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKL4Q5MAI5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKL4Q5MAI5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKL4Q5MAI5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKL4Q5MAI5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDKL4Q5MAI5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDKL4Q5MAI5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDKL4Q5MAI5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDKL4Q5MAI5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDKL4Q5MAI5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDKL4Q5MAI5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDKL4Q5MAI5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDKL4Q5MAI5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDKL4Q5MAI5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDKL4Q5MAI5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDKL4Q5MAI5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL4Q5MAI5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL4Q5MAI5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL4Q5MAI5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL4Q5MAI5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL4Q5MAI5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL4Q5MAI5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL4Q5MAI5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL4Q5MAI5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL4Q5MAI5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL4Q5MAI5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL4Q5MAI5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL4Q5MAI5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDKL4Q5MAI5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDKL4Q5MAI5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDKL4Q5MAI5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDKL4Q5MAI5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDKL4Q5MAI5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKL4Q5MAI5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKL4Q5MAI5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKL4Q5MAI5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDKL4Q5MAI5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDKL4Q5MAI5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDKL4Q5MAI5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDKL4Q5MAI5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDKL4Q5MAI5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms