Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf116Q5BN46 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms