Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN52Q52LA3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIN52Q52LA3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIN52Q52LA3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIN52Q52LA3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIN52Q52LA3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIN52Q52LA3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIN52Q52LA3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIN52Q52LA3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIN52Q52LA3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIN52Q52LA3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIN52Q52LA3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LIN52Q52LA3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
LIN52Q52LA3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIN52Q52LA3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIN52Q52LA3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIN52Q52LA3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIN52Q52LA3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIN52Q52LA3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIN52Q52LA3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIN52Q52LA3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIN52Q52LA3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIN52Q52LA3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIN52Q52LA3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIN52Q52LA3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIN52Q52LA3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIN52Q52LA3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIN52Q52LA3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIN52Q52LA3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LIN52Q52LA3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIN52Q52LA3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIN52Q52LA3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIN52Q52LA3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIN52Q52LA3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIN52Q52LA3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIN52Q52LA3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN52Q52LA3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN52Q52LA3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN52Q52LA3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN52Q52LA3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN52Q52LA3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN52Q52LA3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN52Q52LA3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN52Q52LA3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN52Q52LA3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN52Q52LA3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN52Q52LA3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN52Q52LA3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN52Q52LA3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN52Q52LA3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN52Q52LA3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN52Q52LA3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIN52Q52LA3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIN52Q52LA3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIN52Q52LA3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIN52Q52LA3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIN52Q52LA3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIN52Q52LA3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LIN52Q52LA3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIN52Q52LA3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIN52Q52LA3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIN52Q52LA3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIN52Q52LA3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIN52Q52LA3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIN52Q52LA3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIN52Q52LA3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIN52Q52LA3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIN52Q52LA3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIN52Q52LA3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LIN52Q52LA3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIN52Q52LA3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIN52Q52LA3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIN52Q52LA3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIN52Q52LA3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIN52Q52LA3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIN52Q52LA3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIN52Q52LA3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIN52Q52LA3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIN52Q52LA3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIN52Q52LA3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIN52Q52LA3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIN52Q52LA3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIN52Q52LA3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LIN52Q52LA3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIN52Q52LA3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIN52Q52LA3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIN52Q52LA3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIN52Q52LA3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LIN52Q52LA3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIN52Q52LA3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIN52Q52LA3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LIN52Q52LA3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIN52Q52LA3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIN52Q52LA3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIN52Q52LA3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIN52Q52LA3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIN52Q52LA3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIN52Q52LA3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIN52Q52LA3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIN52Q52LA3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms