Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GREB1Q4ZG55 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GREB1Q4ZG55 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GREB1Q4ZG55 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GREB1Q4ZG55 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GREB1Q4ZG55 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GREB1Q4ZG55 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GREB1Q4ZG55 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GREB1Q4ZG55 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GREB1Q4ZG55 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GREB1Q4ZG55 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GREB1Q4ZG55 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GREB1Q4ZG55 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GREB1Q4ZG55 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GREB1Q4ZG55 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GREB1Q4ZG55 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GREB1Q4ZG55 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GREB1Q4ZG55 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GREB1Q4ZG55 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GREB1Q4ZG55 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GREB1Q4ZG55 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GREB1Q4ZG55 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GREB1Q4ZG55 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GREB1Q4ZG55 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GREB1Q4ZG55 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GREB1Q4ZG55 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GREB1Q4ZG55 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GREB1Q4ZG55 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GREB1Q4ZG55 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GREB1Q4ZG55 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GREB1Q4ZG55 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GREB1Q4ZG55 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GREB1Q4ZG55 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GREB1Q4ZG55 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GREB1Q4ZG55 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GREB1Q4ZG55 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GREB1Q4ZG55 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GREB1Q4ZG55 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GREB1Q4ZG55 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GREB1Q4ZG55 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GREB1Q4ZG55 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GREB1Q4ZG55 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GREB1Q4ZG55 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GREB1Q4ZG55 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GREB1Q4ZG55 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GREB1Q4ZG55 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GREB1Q4ZG55 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GREB1Q4ZG55 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GREB1Q4ZG55 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GREB1Q4ZG55 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GREB1Q4ZG55 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GREB1Q4ZG55 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GREB1Q4ZG55 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GREB1Q4ZG55 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GREB1Q4ZG55 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GREB1Q4ZG55 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GREB1Q4ZG55 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GREB1Q4ZG55 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GREB1Q4ZG55 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GREB1Q4ZG55 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GREB1Q4ZG55 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GREB1Q4ZG55 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GREB1Q4ZG55 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GREB1Q4ZG55 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GREB1Q4ZG55 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GREB1Q4ZG55 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GREB1Q4ZG55 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GREB1Q4ZG55 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GREB1Q4ZG55 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GREB1Q4ZG55 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GREB1Q4ZG55 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GREB1Q4ZG55 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GREB1Q4ZG55 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GREB1Q4ZG55 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GREB1Q4ZG55 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GREB1Q4ZG55 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GREB1Q4ZG55 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GREB1Q4ZG55 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GREB1Q4ZG55 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GREB1Q4ZG55 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.2 ms