Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0T1

Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SCART1, humanhuman

Predictions only

Length 1,027 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q4G0T1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Q4G0T1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Q4G0T1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Q4G0T1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Q4G0T1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Q4G0T1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Q4G0T1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Q4G0T1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Q4G0T1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Q4G0T1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Q4G0T1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Q4G0T1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Q4G0T1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Q4G0T1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Q4G0T1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Q4G0T1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Q4G0T1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Q4G0T1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Q4G0T1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Q4G0T1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Q4G0T1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Q4G0T1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Q4G0T1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Q4G0T1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Q4G0T1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Q4G0T1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Q4G0T1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Q4G0T1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Q4G0T1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Q4G0T1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Q4G0T1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Q4G0T1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Q4G0T1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Q4G0T1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Q4G0T1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Q4G0T1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Q4G0T1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Q4G0T1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Q4G0T1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Q4G0T1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Q4G0T1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Q4G0T1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Q4G0T1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Q4G0T1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Q4G0T1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Q4G0T1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Q4G0T1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Q4G0T1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Q4G0T1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Q4G0T1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Q4G0T1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Q4G0T1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Q4G0T1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Q4G0T1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Q4G0T1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Q4G0T1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Q4G0T1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Q4G0T1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Q4G0T1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Q4G0T1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Q4G0T1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Q4G0T1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Q4G0T1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Q4G0T1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Q4G0T1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Q4G0T1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Q4G0T1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Q4G0T1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Q4G0T1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Q4G0T1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Q4G0T1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Q4G0T1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Q4G0T1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Q4G0T1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Q4G0T1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Q4G0T1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Q4G0T1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Q4G0T1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Q4G0T1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Q4G0T1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Q4G0T1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Q4G0T1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Q4G0T1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Q4G0T1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Q4G0T1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Q4G0T1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Q4G0T1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Q4G0T1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Q4G0T1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Q4G0T1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Q4G0T1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Q4G0T1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Q4G0T1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Q4G0T1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Q4G0T1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Q4G0T1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Q4G0T1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Q4G0T1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Q4G0T1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Q4G0T1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms