Protein–RNA interactions for Protein: Q496J9

SV2C, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2CQ496J9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SV2CQ496J9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SV2CQ496J9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SV2CQ496J9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SV2CQ496J9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SV2CQ496J9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SV2CQ496J9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SV2CQ496J9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SV2CQ496J9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SV2CQ496J9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SV2CQ496J9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SV2CQ496J9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
SV2CQ496J9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SV2CQ496J9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SV2CQ496J9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SV2CQ496J9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SV2CQ496J9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SV2CQ496J9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SV2CQ496J9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SV2CQ496J9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SV2CQ496J9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SV2CQ496J9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SV2CQ496J9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SV2CQ496J9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SV2CQ496J9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SV2CQ496J9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SV2CQ496J9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SV2CQ496J9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SV2CQ496J9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SV2CQ496J9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SV2CQ496J9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SV2CQ496J9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SV2CQ496J9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SV2CQ496J9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SV2CQ496J9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SV2CQ496J9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SV2CQ496J9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SV2CQ496J9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SV2CQ496J9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SV2CQ496J9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SV2CQ496J9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SV2CQ496J9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SV2CQ496J9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SV2CQ496J9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SV2CQ496J9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SV2CQ496J9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SV2CQ496J9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SV2CQ496J9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SV2CQ496J9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SV2CQ496J9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SV2CQ496J9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SV2CQ496J9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SV2CQ496J9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SV2CQ496J9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SV2CQ496J9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SV2CQ496J9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SV2CQ496J9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SV2CQ496J9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SV2CQ496J9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SV2CQ496J9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SV2CQ496J9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SV2CQ496J9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SV2CQ496J9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SV2CQ496J9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SV2CQ496J9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SV2CQ496J9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SV2CQ496J9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SV2CQ496J9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SV2CQ496J9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SV2CQ496J9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SV2CQ496J9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SV2CQ496J9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SV2CQ496J9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SV2CQ496J9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SV2CQ496J9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SV2CQ496J9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SV2CQ496J9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SV2CQ496J9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SV2CQ496J9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SV2CQ496J9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SV2CQ496J9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SV2CQ496J9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SV2CQ496J9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SV2CQ496J9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SV2CQ496J9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SV2CQ496J9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SV2CQ496J9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SV2CQ496J9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SV2CQ496J9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SV2CQ496J9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SV2CQ496J9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SV2CQ496J9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SV2CQ496J9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SV2CQ496J9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SV2CQ496J9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SV2CQ496J9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SV2CQ496J9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SV2CQ496J9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SV2CQ496J9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SV2CQ496J9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms