Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00303Q3SY05 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00303Q3SY05 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00303Q3SY05 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00303Q3SY05 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00303Q3SY05 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00303Q3SY05 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00303Q3SY05 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00303Q3SY05 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00303Q3SY05 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00303Q3SY05 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00303Q3SY05 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00303Q3SY05 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00303Q3SY05 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00303Q3SY05 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00303Q3SY05 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00303Q3SY05 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00303Q3SY05 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00303Q3SY05 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00303Q3SY05 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00303Q3SY05 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00303Q3SY05 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00303Q3SY05 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00303Q3SY05 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00303Q3SY05 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00303Q3SY05 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00303Q3SY05 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00303Q3SY05 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00303Q3SY05 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00303Q3SY05 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00303Q3SY05 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00303Q3SY05 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00303Q3SY05 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00303Q3SY05 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00303Q3SY05 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00303Q3SY05 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00303Q3SY05 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00303Q3SY05 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00303Q3SY05 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00303Q3SY05 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00303Q3SY05 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00303Q3SY05 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00303Q3SY05 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00303Q3SY05 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00303Q3SY05 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00303Q3SY05 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00303Q3SY05 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00303Q3SY05 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00303Q3SY05 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00303Q3SY05 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00303Q3SY05 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00303Q3SY05 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00303Q3SY05 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00303Q3SY05 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00303Q3SY05 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00303Q3SY05 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00303Q3SY05 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00303Q3SY05 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00303Q3SY05 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms