Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTLL9Q3SXZ7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTLL9Q3SXZ7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTLL9Q3SXZ7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTLL9Q3SXZ7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTLL9Q3SXZ7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTLL9Q3SXZ7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTLL9Q3SXZ7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTLL9Q3SXZ7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTLL9Q3SXZ7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTLL9Q3SXZ7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTLL9Q3SXZ7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTLL9Q3SXZ7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTLL9Q3SXZ7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTLL9Q3SXZ7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTLL9Q3SXZ7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL9Q3SXZ7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL9Q3SXZ7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL9Q3SXZ7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL9Q3SXZ7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL9Q3SXZ7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL9Q3SXZ7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL9Q3SXZ7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL9Q3SXZ7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL9Q3SXZ7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL9Q3SXZ7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL9Q3SXZ7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL9Q3SXZ7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL9Q3SXZ7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL9Q3SXZ7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL9Q3SXZ7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL9Q3SXZ7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL9Q3SXZ7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL9Q3SXZ7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL9Q3SXZ7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL9Q3SXZ7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL9Q3SXZ7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL9Q3SXZ7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL9Q3SXZ7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL9Q3SXZ7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL9Q3SXZ7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL9Q3SXZ7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL9Q3SXZ7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL9Q3SXZ7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL9Q3SXZ7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL9Q3SXZ7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL9Q3SXZ7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL9Q3SXZ7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL9Q3SXZ7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL9Q3SXZ7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL9Q3SXZ7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL9Q3SXZ7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL9Q3SXZ7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL9Q3SXZ7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL9Q3SXZ7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL9Q3SXZ7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL9Q3SXZ7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL9Q3SXZ7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL9Q3SXZ7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL9Q3SXZ7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL9Q3SXZ7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL9Q3SXZ7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL9Q3SXZ7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL9Q3SXZ7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL9Q3SXZ7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL9Q3SXZ7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL9Q3SXZ7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL9Q3SXZ7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL9Q3SXZ7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL9Q3SXZ7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL9Q3SXZ7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL9Q3SXZ7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL9Q3SXZ7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL9Q3SXZ7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL9Q3SXZ7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL9Q3SXZ7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL9Q3SXZ7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL9Q3SXZ7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL9Q3SXZ7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL9Q3SXZ7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL9Q3SXZ7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL9Q3SXZ7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL9Q3SXZ7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL9Q3SXZ7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL9Q3SXZ7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL9Q3SXZ7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL9Q3SXZ7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL9Q3SXZ7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL9Q3SXZ7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL9Q3SXZ7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL9Q3SXZ7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL9Q3SXZ7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL9Q3SXZ7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL9Q3SXZ7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL9Q3SXZ7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL9Q3SXZ7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL9Q3SXZ7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TTLL9Q3SXZ7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms