Protein–RNA interactions for Protein: Q3SX64

ODF3L2, Outer dense fiber protein 3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3L2Q3SX64 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF3L2Q3SX64 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF3L2Q3SX64 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF3L2Q3SX64 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF3L2Q3SX64 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF3L2Q3SX64 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF3L2Q3SX64 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF3L2Q3SX64 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF3L2Q3SX64 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF3L2Q3SX64 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF3L2Q3SX64 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF3L2Q3SX64 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF3L2Q3SX64 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF3L2Q3SX64 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF3L2Q3SX64 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF3L2Q3SX64 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF3L2Q3SX64 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF3L2Q3SX64 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF3L2Q3SX64 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF3L2Q3SX64 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF3L2Q3SX64 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF3L2Q3SX64 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms