Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LSM12Q3MHD2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LSM12Q3MHD2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LSM12Q3MHD2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LSM12Q3MHD2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LSM12Q3MHD2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LSM12Q3MHD2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSM12Q3MHD2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSM12Q3MHD2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSM12Q3MHD2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSM12Q3MHD2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSM12Q3MHD2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LSM12Q3MHD2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LSM12Q3MHD2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LSM12Q3MHD2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LSM12Q3MHD2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LSM12Q3MHD2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LSM12Q3MHD2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LSM12Q3MHD2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LSM12Q3MHD2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LSM12Q3MHD2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LSM12Q3MHD2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LSM12Q3MHD2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LSM12Q3MHD2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSM12Q3MHD2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSM12Q3MHD2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSM12Q3MHD2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSM12Q3MHD2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSM12Q3MHD2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LSM12Q3MHD2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LSM12Q3MHD2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LSM12Q3MHD2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LSM12Q3MHD2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LSM12Q3MHD2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LSM12Q3MHD2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LSM12Q3MHD2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LSM12Q3MHD2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LSM12Q3MHD2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LSM12Q3MHD2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LSM12Q3MHD2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LSM12Q3MHD2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LSM12Q3MHD2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LSM12Q3MHD2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LSM12Q3MHD2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSM12Q3MHD2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSM12Q3MHD2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSM12Q3MHD2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSM12Q3MHD2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSM12Q3MHD2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSM12Q3MHD2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSM12Q3MHD2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LSM12Q3MHD2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LSM12Q3MHD2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LSM12Q3MHD2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LSM12Q3MHD2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LSM12Q3MHD2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LSM12Q3MHD2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LSM12Q3MHD2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LSM12Q3MHD2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSM12Q3MHD2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSM12Q3MHD2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSM12Q3MHD2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LSM12Q3MHD2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LSM12Q3MHD2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSM12Q3MHD2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSM12Q3MHD2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSM12Q3MHD2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSM12Q3MHD2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LSM12Q3MHD2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LSM12Q3MHD2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LSM12Q3MHD2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LSM12Q3MHD2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LSM12Q3MHD2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LSM12Q3MHD2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LSM12Q3MHD2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LSM12Q3MHD2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LSM12Q3MHD2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LSM12Q3MHD2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LSM12Q3MHD2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LSM12Q3MHD2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LSM12Q3MHD2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LSM12Q3MHD2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LSM12Q3MHD2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LSM12Q3MHD2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LSM12Q3MHD2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSM12Q3MHD2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSM12Q3MHD2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSM12Q3MHD2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LSM12Q3MHD2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LSM12Q3MHD2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LSM12Q3MHD2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LSM12Q3MHD2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LSM12Q3MHD2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LSM12Q3MHD2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LSM12Q3MHD2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LSM12Q3MHD2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LSM12Q3MHD2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSM12Q3MHD2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSM12Q3MHD2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSM12Q3MHD2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms