Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI54

KRTAP19-8, Keratin-associated protein 19-8, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP19-8Q3LI54 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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KRTAP19-8Q3LI54 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
KRTAP19-8Q3LI54 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP19-8Q3LI54 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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KRTAP19-8Q3LI54 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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KRTAP19-8Q3LI54 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP19-8Q3LI54 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP19-8Q3LI54 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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KRTAP19-8Q3LI54 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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KRTAP19-8Q3LI54 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP19-8Q3LI54 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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KRTAP19-8Q3LI54 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP19-8Q3LI54 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP19-8Q3LI54 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP19-8Q3LI54 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP19-8Q3LI54 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP19-8Q3LI54 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP19-8Q3LI54 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP19-8Q3LI54 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP19-8Q3LI54 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP19-8Q3LI54 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP19-8Q3LI54 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP19-8Q3LI54 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP19-8Q3LI54 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP19-8Q3LI54 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP19-8Q3LI54 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP19-8Q3LI54 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP19-8Q3LI54 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP19-8Q3LI54 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP19-8Q3LI54 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP19-8Q3LI54 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP19-8Q3LI54 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP19-8Q3LI54 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP19-8Q3LI54 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP19-8Q3LI54 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP19-8Q3LI54 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP19-8Q3LI54 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP19-8Q3LI54 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP19-8Q3LI54 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP19-8Q3LI54 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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