Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
KRTAP25-1Q3LHN0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms