Protein–RNA interactions for Protein: Q32M88

PGGHG, Protein-glucosylgalactosylhydroxylysine glucosidase, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGHGQ32M88 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGGHGQ32M88 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGGHGQ32M88 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGGHGQ32M88 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGGHGQ32M88 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PGGHGQ32M88 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGGHGQ32M88 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGGHGQ32M88 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGGHGQ32M88 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGGHGQ32M88 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGGHGQ32M88 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGGHGQ32M88 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGGHGQ32M88 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGGHGQ32M88 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGGHGQ32M88 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGGHGQ32M88 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGGHGQ32M88 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGGHGQ32M88 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGGHGQ32M88 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGGHGQ32M88 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGGHGQ32M88 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGGHGQ32M88 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGGHGQ32M88 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGGHGQ32M88 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGGHGQ32M88 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PGGHGQ32M88 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGGHGQ32M88 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGGHGQ32M88 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGGHGQ32M88 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGGHGQ32M88 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGGHGQ32M88 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGGHGQ32M88 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGGHGQ32M88 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGGHGQ32M88 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGGHGQ32M88 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGGHGQ32M88 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGGHGQ32M88 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGGHGQ32M88 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGGHGQ32M88 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGGHGQ32M88 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGGHGQ32M88 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGGHGQ32M88 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGGHGQ32M88 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGGHGQ32M88 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGGHGQ32M88 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PGGHGQ32M88 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGGHGQ32M88 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGGHGQ32M88 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGGHGQ32M88 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGGHGQ32M88 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGGHGQ32M88 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGGHGQ32M88 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGGHGQ32M88 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGGHGQ32M88 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGGHGQ32M88 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGGHGQ32M88 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGGHGQ32M88 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGGHGQ32M88 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGGHGQ32M88 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGGHGQ32M88 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGGHGQ32M88 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGGHGQ32M88 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGGHGQ32M88 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGGHGQ32M88 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PGGHGQ32M88 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGGHGQ32M88 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGGHGQ32M88 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGGHGQ32M88 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGGHGQ32M88 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGGHGQ32M88 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGGHGQ32M88 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGGHGQ32M88 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGGHGQ32M88 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGGHGQ32M88 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGGHGQ32M88 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PGGHGQ32M88 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PGGHGQ32M88 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGGHGQ32M88 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGGHGQ32M88 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGGHGQ32M88 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGGHGQ32M88 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGGHGQ32M88 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGGHGQ32M88 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGGHGQ32M88 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGGHGQ32M88 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGGHGQ32M88 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGGHGQ32M88 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGGHGQ32M88 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGGHGQ32M88 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGGHGQ32M88 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGGHGQ32M88 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGGHGQ32M88 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGGHGQ32M88 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGGHGQ32M88 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGGHGQ32M88 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGGHGQ32M88 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGGHGQ32M88 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGGHGQ32M88 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGGHGQ32M88 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGGHGQ32M88 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms