Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HFEQ30201 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HFEQ30201 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HFEQ30201 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HFEQ30201 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HFEQ30201 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HFEQ30201 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HFEQ30201 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HFEQ30201 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HFEQ30201 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HFEQ30201 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HFEQ30201 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HFEQ30201 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HFEQ30201 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HFEQ30201 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HFEQ30201 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HFEQ30201 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HFEQ30201 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HFEQ30201 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HFEQ30201 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HFEQ30201 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HFEQ30201 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HFEQ30201 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HFEQ30201 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HFEQ30201 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HFEQ30201 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HFEQ30201 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HFEQ30201 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HFEQ30201 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HFEQ30201 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HFEQ30201 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HFEQ30201 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HFEQ30201 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HFEQ30201 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HFEQ30201 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HFEQ30201 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HFEQ30201 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HFEQ30201 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HFEQ30201 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HFEQ30201 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HFEQ30201 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HFEQ30201 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HFEQ30201 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HFEQ30201 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HFEQ30201 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HFEQ30201 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HFEQ30201 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HFEQ30201 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HFEQ30201 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HFEQ30201 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HFEQ30201 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HFEQ30201 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HFEQ30201 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HFEQ30201 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HFEQ30201 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HFEQ30201 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HFEQ30201 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HFEQ30201 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HFEQ30201 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HFEQ30201 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HFEQ30201 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HFEQ30201 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HFEQ30201 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HFEQ30201 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HFEQ30201 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HFEQ30201 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HFEQ30201 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HFEQ30201 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
HFEQ30201 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
HFEQ30201 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HFEQ30201 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HFEQ30201 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HFEQ30201 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HFEQ30201 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HFEQ30201 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HFEQ30201 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HFEQ30201 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HFEQ30201 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HFEQ30201 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HFEQ30201 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HFEQ30201 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HFEQ30201 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HFEQ30201 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HFEQ30201 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HFEQ30201 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HFEQ30201 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HFEQ30201 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HFEQ30201 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HFEQ30201 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HFEQ30201 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HFEQ30201 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HFEQ30201 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HFEQ30201 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HFEQ30201 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HFEQ30201 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HFEQ30201 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HFEQ30201 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HFEQ30201 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HFEQ30201 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HFEQ30201 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms