Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VWC2Q2TAL6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VWC2Q2TAL6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VWC2Q2TAL6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VWC2Q2TAL6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VWC2Q2TAL6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VWC2Q2TAL6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VWC2Q2TAL6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VWC2Q2TAL6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VWC2Q2TAL6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VWC2Q2TAL6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VWC2Q2TAL6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VWC2Q2TAL6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VWC2Q2TAL6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
VWC2Q2TAL6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VWC2Q2TAL6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
VWC2Q2TAL6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VWC2Q2TAL6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms