Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q1T7F1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q1T7F1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q1T7F1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q1T7F1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q1T7F1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q1T7F1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q1T7F1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q1T7F1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q1T7F1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q1T7F1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q1T7F1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q1T7F1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q1T7F1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q1T7F1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q1T7F1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q1T7F1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q1T7F1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q1T7F1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q1T7F1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q1T7F1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q1T7F1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q1T7F1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q1T7F1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q1T7F1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q1T7F1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q1T7F1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q1T7F1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q1T7F1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q1T7F1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q1T7F1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q1T7F1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q1T7F1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q1T7F1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q1T7F1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q1T7F1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q1T7F1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q1T7F1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q1T7F1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q1T7F1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q1T7F1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q1T7F1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q1T7F1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q1T7F1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q1T7F1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q1T7F1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q1T7F1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q1T7F1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q1T7F1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q1T7F1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q1T7F1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q1T7F1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q1T7F1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q1T7F1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q1T7F1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q1T7F1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q1T7F1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q1T7F1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q1T7F1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q1T7F1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q1T7F1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q1T7F1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q1T7F1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q1T7F1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q1T7F1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q1T7F1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q1T7F1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q1T7F1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q1T7F1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q1T7F1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q1T7F1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q1T7F1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q1T7F1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Q1T7F1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q1T7F1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q1T7F1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q1T7F1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q1T7F1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Q1T7F1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q1T7F1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q1T7F1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q1T7F1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q1T7F1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q1T7F1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Q1T7F1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q1T7F1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q1T7F1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q1T7F1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q1T7F1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q1T7F1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q1T7F1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q1T7F1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q1T7F1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q1T7F1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q1T7F1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q1T7F1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q1T7F1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q1T7F1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Q1T7F1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q1T7F1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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